Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TspoP50637 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TspoP50637 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TspoP50637 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TspoP50637 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TspoP50637 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TspoP50637 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TspoP50637 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TspoP50637 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TspoP50637 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TspoP50637 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TspoP50637 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TspoP50637 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TspoP50637 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TspoP50637 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TspoP50637 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TspoP50637 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TspoP50637 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TspoP50637 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TspoP50637 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TspoP50637 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TspoP50637 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TspoP50637 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TspoP50637 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TspoP50637 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TspoP50637 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TspoP50637 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TspoP50637 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TspoP50637 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TspoP50637 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TspoP50637 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TspoP50637 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TspoP50637 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TspoP50637 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TspoP50637 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TspoP50637 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TspoP50637 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TspoP50637 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TspoP50637 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TspoP50637 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TspoP50637 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TspoP50637 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TspoP50637 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TspoP50637 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TspoP50637 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TspoP50637 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TspoP50637 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TspoP50637 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TspoP50637 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TspoP50637 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TspoP50637 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TspoP50637 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TspoP50637 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TspoP50637 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TspoP50637 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TspoP50637 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TspoP50637 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TspoP50637 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TspoP50637 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TspoP50637 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TspoP50637 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TspoP50637 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TspoP50637 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TspoP50637 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TspoP50637 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TspoP50637 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TspoP50637 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TspoP50637 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TspoP50637 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
TspoP50637 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TspoP50637 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TspoP50637 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TspoP50637 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TspoP50637 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TspoP50637 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TspoP50637 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TspoP50637 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TspoP50637 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TspoP50637 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TspoP50637 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TspoP50637 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
TspoP50637 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TspoP50637 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TspoP50637 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TspoP50637 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TspoP50637 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TspoP50637 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TspoP50637 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
TspoP50637 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TspoP50637 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TspoP50637 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
TspoP50637 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TspoP50637 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TspoP50637 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TspoP50637 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TspoP50637 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TspoP50637 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TspoP50637 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TspoP50637 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TspoP50637 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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