Protein–RNA interactions for Protein: P50404

Sftpd, Pulmonary surfactant-associated protein D, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpdP50404 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SftpdP50404 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SftpdP50404 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SftpdP50404 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SftpdP50404 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SftpdP50404 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SftpdP50404 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SftpdP50404 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SftpdP50404 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SftpdP50404 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SftpdP50404 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SftpdP50404 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SftpdP50404 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SftpdP50404 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SftpdP50404 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SftpdP50404 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SftpdP50404 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SftpdP50404 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SftpdP50404 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SftpdP50404 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SftpdP50404 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SftpdP50404 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SftpdP50404 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SftpdP50404 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SftpdP50404 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SftpdP50404 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SftpdP50404 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SftpdP50404 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SftpdP50404 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SftpdP50404 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
SftpdP50404 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SftpdP50404 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SftpdP50404 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SftpdP50404 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SftpdP50404 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SftpdP50404 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SftpdP50404 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SftpdP50404 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SftpdP50404 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SftpdP50404 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SftpdP50404 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SftpdP50404 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SftpdP50404 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SftpdP50404 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SftpdP50404 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SftpdP50404 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SftpdP50404 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SftpdP50404 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SftpdP50404 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SftpdP50404 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SftpdP50404 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SftpdP50404 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SftpdP50404 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
SftpdP50404 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
SftpdP50404 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SftpdP50404 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SftpdP50404 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SftpdP50404 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SftpdP50404 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SftpdP50404 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SftpdP50404 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SftpdP50404 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SftpdP50404 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SftpdP50404 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SftpdP50404 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SftpdP50404 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SftpdP50404 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SftpdP50404 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SftpdP50404 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SftpdP50404 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SftpdP50404 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SftpdP50404 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SftpdP50404 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SftpdP50404 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SftpdP50404 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SftpdP50404 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SftpdP50404 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SftpdP50404 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SftpdP50404 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SftpdP50404 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SftpdP50404 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SftpdP50404 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SftpdP50404 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SftpdP50404 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SftpdP50404 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SftpdP50404 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SftpdP50404 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SftpdP50404 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SftpdP50404 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SftpdP50404 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SftpdP50404 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SftpdP50404 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SftpdP50404 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SftpdP50404 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SftpdP50404 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SftpdP50404 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SftpdP50404 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SftpdP50404 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SftpdP50404 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SftpdP50404 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms