Protein–RNA interactions for Protein: P50284

Ltbr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbrP50284 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LtbrP50284 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LtbrP50284 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LtbrP50284 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LtbrP50284 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LtbrP50284 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LtbrP50284 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LtbrP50284 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
LtbrP50284 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LtbrP50284 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LtbrP50284 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LtbrP50284 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LtbrP50284 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LtbrP50284 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LtbrP50284 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LtbrP50284 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LtbrP50284 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LtbrP50284 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LtbrP50284 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LtbrP50284 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LtbrP50284 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LtbrP50284 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
LtbrP50284 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LtbrP50284 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
LtbrP50284 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LtbrP50284 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LtbrP50284 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LtbrP50284 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LtbrP50284 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LtbrP50284 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LtbrP50284 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LtbrP50284 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LtbrP50284 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LtbrP50284 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LtbrP50284 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LtbrP50284 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LtbrP50284 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
LtbrP50284 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LtbrP50284 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LtbrP50284 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LtbrP50284 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
LtbrP50284 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LtbrP50284 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LtbrP50284 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LtbrP50284 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LtbrP50284 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LtbrP50284 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LtbrP50284 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LtbrP50284 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LtbrP50284 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LtbrP50284 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
LtbrP50284 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LtbrP50284 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LtbrP50284 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LtbrP50284 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LtbrP50284 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LtbrP50284 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LtbrP50284 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LtbrP50284 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LtbrP50284 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LtbrP50284 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LtbrP50284 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LtbrP50284 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LtbrP50284 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.83■■□□□ 1.4
LtbrP50284 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
LtbrP50284 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LtbrP50284 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LtbrP50284 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LtbrP50284 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LtbrP50284 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LtbrP50284 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LtbrP50284 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LtbrP50284 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LtbrP50284 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LtbrP50284 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LtbrP50284 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LtbrP50284 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LtbrP50284 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LtbrP50284 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LtbrP50284 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LtbrP50284 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LtbrP50284 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LtbrP50284 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LtbrP50284 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LtbrP50284 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LtbrP50284 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LtbrP50284 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LtbrP50284 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LtbrP50284 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
LtbrP50284 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LtbrP50284 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LtbrP50284 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
LtbrP50284 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LtbrP50284 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
LtbrP50284 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LtbrP50284 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LtbrP50284 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LtbrP50284 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LtbrP50284 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LtbrP50284 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms