Protein–RNA interactions for Protein: P49766

Vegfb, Vascular endothelial growth factor B, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfbP49766 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VegfbP49766 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VegfbP49766 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VegfbP49766 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VegfbP49766 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VegfbP49766 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VegfbP49766 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VegfbP49766 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VegfbP49766 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VegfbP49766 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VegfbP49766 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VegfbP49766 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VegfbP49766 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VegfbP49766 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
VegfbP49766 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VegfbP49766 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VegfbP49766 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
VegfbP49766 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
VegfbP49766 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
VegfbP49766 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
VegfbP49766 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
VegfbP49766 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
VegfbP49766 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VegfbP49766 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VegfbP49766 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VegfbP49766 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VegfbP49766 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VegfbP49766 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VegfbP49766 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VegfbP49766 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VegfbP49766 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VegfbP49766 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VegfbP49766 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VegfbP49766 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VegfbP49766 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VegfbP49766 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VegfbP49766 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VegfbP49766 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VegfbP49766 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VegfbP49766 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VegfbP49766 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VegfbP49766 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VegfbP49766 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VegfbP49766 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VegfbP49766 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VegfbP49766 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VegfbP49766 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VegfbP49766 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VegfbP49766 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VegfbP49766 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VegfbP49766 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VegfbP49766 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VegfbP49766 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VegfbP49766 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VegfbP49766 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VegfbP49766 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
VegfbP49766 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VegfbP49766 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VegfbP49766 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VegfbP49766 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VegfbP49766 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VegfbP49766 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VegfbP49766 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VegfbP49766 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VegfbP49766 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VegfbP49766 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VegfbP49766 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VegfbP49766 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VegfbP49766 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
VegfbP49766 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VegfbP49766 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VegfbP49766 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VegfbP49766 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VegfbP49766 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VegfbP49766 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VegfbP49766 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VegfbP49766 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VegfbP49766 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VegfbP49766 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VegfbP49766 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VegfbP49766 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VegfbP49766 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VegfbP49766 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VegfbP49766 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VegfbP49766 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VegfbP49766 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
VegfbP49766 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VegfbP49766 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VegfbP49766 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VegfbP49766 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
VegfbP49766 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
VegfbP49766 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
VegfbP49766 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VegfbP49766 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
VegfbP49766 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
VegfbP49766 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VegfbP49766 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VegfbP49766 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VegfbP49766 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VegfbP49766 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms