Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 699 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PtpreP49446 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PtpreP49446 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PtpreP49446 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PtpreP49446 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PtpreP49446 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PtpreP49446 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PtpreP49446 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PtpreP49446 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PtpreP49446 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PtpreP49446 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PtpreP49446 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PtpreP49446 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PtpreP49446 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PtpreP49446 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PtpreP49446 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PtpreP49446 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PtpreP49446 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PtpreP49446 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PtpreP49446 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PtpreP49446 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PtpreP49446 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PtpreP49446 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PtpreP49446 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PtpreP49446 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PtpreP49446 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PtpreP49446 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PtpreP49446 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PtpreP49446 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PtpreP49446 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PtpreP49446 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PtpreP49446 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PtpreP49446 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PtpreP49446 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PtpreP49446 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PtpreP49446 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PtpreP49446 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PtpreP49446 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PtpreP49446 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PtpreP49446 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PtpreP49446 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PtpreP49446 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PtpreP49446 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PtpreP49446 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PtpreP49446 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PtpreP49446 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PtpreP49446 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PtpreP49446 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PtpreP49446 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PtpreP49446 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PtpreP49446 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PtpreP49446 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PtpreP49446 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PtpreP49446 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PtpreP49446 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PtpreP49446 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PtpreP49446 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PtpreP49446 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PtpreP49446 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PtpreP49446 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PtpreP49446 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PtpreP49446 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PtpreP49446 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PtpreP49446 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PtpreP49446 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PtpreP49446 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PtpreP49446 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PtpreP49446 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PtpreP49446 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PtpreP49446 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PtpreP49446 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PtpreP49446 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PtpreP49446 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PtpreP49446 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PtpreP49446 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PtpreP49446 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PtpreP49446 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PtpreP49446 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PtpreP49446 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PtpreP49446 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PtpreP49446 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PtpreP49446 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PtpreP49446 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PtpreP49446 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PtpreP49446 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PtpreP49446 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PtpreP49446 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PtpreP49446 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PtpreP49446 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PtpreP49446 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PtpreP49446 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PtpreP49446 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PtpreP49446 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PtpreP49446 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PtpreP49446 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PtpreP49446 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PtpreP49446 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PtpreP49446 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PtpreP49446 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PtpreP49446 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms