Protein–RNA interactions for Protein: P49312

Hnrnpa1, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hnrnpa1P49312 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hnrnpa1P49312 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hnrnpa1P49312 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Hnrnpa1P49312 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hnrnpa1P49312 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hnrnpa1P49312 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hnrnpa1P49312 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hnrnpa1P49312 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hnrnpa1P49312 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Hnrnpa1P49312 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hnrnpa1P49312 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hnrnpa1P49312 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hnrnpa1P49312 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Hnrnpa1P49312 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Hnrnpa1P49312 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hnrnpa1P49312 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Hnrnpa1P49312 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hnrnpa1P49312 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hnrnpa1P49312 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hnrnpa1P49312 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hnrnpa1P49312 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hnrnpa1P49312 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hnrnpa1P49312 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hnrnpa1P49312 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hnrnpa1P49312 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hnrnpa1P49312 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hnrnpa1P49312 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hnrnpa1P49312 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hnrnpa1P49312 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Hnrnpa1P49312 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hnrnpa1P49312 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hnrnpa1P49312 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hnrnpa1P49312 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hnrnpa1P49312 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hnrnpa1P49312 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hnrnpa1P49312 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hnrnpa1P49312 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hnrnpa1P49312 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hnrnpa1P49312 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hnrnpa1P49312 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Hnrnpa1P49312 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Hnrnpa1P49312 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hnrnpa1P49312 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hnrnpa1P49312 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hnrnpa1P49312 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hnrnpa1P49312 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hnrnpa1P49312 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hnrnpa1P49312 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hnrnpa1P49312 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hnrnpa1P49312 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hnrnpa1P49312 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hnrnpa1P49312 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hnrnpa1P49312 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Hnrnpa1P49312 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hnrnpa1P49312 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hnrnpa1P49312 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hnrnpa1P49312 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hnrnpa1P49312 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hnrnpa1P49312 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hnrnpa1P49312 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hnrnpa1P49312 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hnrnpa1P49312 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hnrnpa1P49312 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hnrnpa1P49312 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hnrnpa1P49312 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hnrnpa1P49312 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hnrnpa1P49312 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hnrnpa1P49312 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hnrnpa1P49312 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hnrnpa1P49312 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hnrnpa1P49312 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hnrnpa1P49312 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hnrnpa1P49312 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hnrnpa1P49312 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hnrnpa1P49312 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hnrnpa1P49312 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hnrnpa1P49312 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hnrnpa1P49312 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hnrnpa1P49312 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hnrnpa1P49312 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hnrnpa1P49312 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Hnrnpa1P49312 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Hnrnpa1P49312 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Hnrnpa1P49312 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hnrnpa1P49312 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hnrnpa1P49312 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hnrnpa1P49312 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hnrnpa1P49312 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hnrnpa1P49312 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Hnrnpa1P49312 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hnrnpa1P49312 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hnrnpa1P49312 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hnrnpa1P49312 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hnrnpa1P49312 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hnrnpa1P49312 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hnrnpa1P49312 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hnrnpa1P49312 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Hnrnpa1P49312 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hnrnpa1P49312 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hnrnpa1P49312 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms