Protein–RNA interactions for Protein: P49025

Cit, Citron Rho-interacting kinase, mousemouse

Predictions only

Length 2,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CitP49025 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CitP49025 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CitP49025 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CitP49025 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CitP49025 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CitP49025 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CitP49025 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CitP49025 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CitP49025 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CitP49025 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CitP49025 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CitP49025 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CitP49025 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CitP49025 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CitP49025 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CitP49025 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CitP49025 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CitP49025 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CitP49025 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CitP49025 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CitP49025 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CitP49025 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CitP49025 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CitP49025 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CitP49025 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CitP49025 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CitP49025 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CitP49025 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CitP49025 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CitP49025 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CitP49025 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CitP49025 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CitP49025 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CitP49025 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CitP49025 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CitP49025 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CitP49025 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CitP49025 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CitP49025 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CitP49025 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CitP49025 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CitP49025 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CitP49025 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CitP49025 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CitP49025 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CitP49025 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
CitP49025 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CitP49025 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CitP49025 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CitP49025 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CitP49025 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CitP49025 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CitP49025 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CitP49025 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CitP49025 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CitP49025 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CitP49025 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CitP49025 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CitP49025 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CitP49025 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CitP49025 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CitP49025 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CitP49025 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CitP49025 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CitP49025 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CitP49025 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CitP49025 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CitP49025 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CitP49025 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CitP49025 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CitP49025 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CitP49025 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CitP49025 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CitP49025 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CitP49025 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CitP49025 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CitP49025 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CitP49025 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CitP49025 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CitP49025 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CitP49025 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CitP49025 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CitP49025 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CitP49025 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CitP49025 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CitP49025 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CitP49025 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CitP49025 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CitP49025 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CitP49025 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CitP49025 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CitP49025 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CitP49025 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CitP49025 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CitP49025 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CitP49025 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CitP49025 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CitP49025 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CitP49025 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CitP49025 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms