Protein–RNA interactions for Protein: P48787

Tnni3, Troponin I, cardiac muscle, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni3P48787 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tnni3P48787 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tnni3P48787 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tnni3P48787 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tnni3P48787 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tnni3P48787 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tnni3P48787 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tnni3P48787 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tnni3P48787 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tnni3P48787 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tnni3P48787 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tnni3P48787 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tnni3P48787 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tnni3P48787 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Tnni3P48787 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tnni3P48787 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tnni3P48787 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Tnni3P48787 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tnni3P48787 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tnni3P48787 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tnni3P48787 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tnni3P48787 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tnni3P48787 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Tnni3P48787 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tnni3P48787 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Tnni3P48787 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tnni3P48787 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tnni3P48787 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tnni3P48787 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tnni3P48787 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tnni3P48787 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tnni3P48787 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tnni3P48787 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tnni3P48787 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tnni3P48787 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tnni3P48787 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tnni3P48787 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tnni3P48787 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tnni3P48787 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tnni3P48787 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tnni3P48787 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tnni3P48787 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tnni3P48787 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tnni3P48787 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tnni3P48787 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tnni3P48787 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tnni3P48787 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tnni3P48787 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tnni3P48787 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tnni3P48787 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tnni3P48787 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tnni3P48787 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tnni3P48787 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tnni3P48787 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tnni3P48787 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tnni3P48787 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tnni3P48787 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tnni3P48787 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tnni3P48787 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tnni3P48787 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tnni3P48787 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tnni3P48787 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tnni3P48787 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tnni3P48787 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tnni3P48787 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tnni3P48787 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tnni3P48787 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Tnni3P48787 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tnni3P48787 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tnni3P48787 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tnni3P48787 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tnni3P48787 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tnni3P48787 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tnni3P48787 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tnni3P48787 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tnni3P48787 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tnni3P48787 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tnni3P48787 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tnni3P48787 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tnni3P48787 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tnni3P48787 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tnni3P48787 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tnni3P48787 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tnni3P48787 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tnni3P48787 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tnni3P48787 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tnni3P48787 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Tnni3P48787 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tnni3P48787 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tnni3P48787 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tnni3P48787 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tnni3P48787 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tnni3P48787 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tnni3P48787 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tnni3P48787 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tnni3P48787 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tnni3P48787 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tnni3P48787 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tnni3P48787 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tnni3P48787 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms