Protein–RNA interactions for Protein: P48754

Brca1, Breast cancer type 1 susceptibility protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brca1P48754 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Brca1P48754 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Brca1P48754 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Brca1P48754 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Brca1P48754 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Brca1P48754 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Brca1P48754 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Brca1P48754 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Brca1P48754 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Brca1P48754 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Brca1P48754 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Brca1P48754 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Brca1P48754 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Brca1P48754 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Brca1P48754 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Brca1P48754 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Brca1P48754 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Brca1P48754 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Brca1P48754 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Brca1P48754 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Brca1P48754 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Brca1P48754 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Brca1P48754 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Brca1P48754 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Brca1P48754 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Brca1P48754 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Brca1P48754 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Brca1P48754 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Brca1P48754 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Brca1P48754 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Brca1P48754 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Brca1P48754 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Brca1P48754 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Brca1P48754 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Brca1P48754 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Brca1P48754 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Brca1P48754 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Brca1P48754 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Brca1P48754 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Brca1P48754 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Brca1P48754 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Brca1P48754 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Brca1P48754 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Brca1P48754 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Brca1P48754 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Brca1P48754 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Brca1P48754 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Brca1P48754 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Brca1P48754 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Brca1P48754 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Brca1P48754 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Brca1P48754 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Brca1P48754 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Brca1P48754 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Brca1P48754 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Brca1P48754 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Brca1P48754 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Brca1P48754 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Brca1P48754 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Brca1P48754 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Brca1P48754 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Brca1P48754 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Brca1P48754 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Brca1P48754 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Brca1P48754 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Brca1P48754 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Brca1P48754 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Brca1P48754 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Brca1P48754 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Brca1P48754 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Brca1P48754 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Brca1P48754 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Brca1P48754 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Brca1P48754 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Brca1P48754 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Brca1P48754 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Brca1P48754 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Brca1P48754 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Brca1P48754 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Brca1P48754 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Brca1P48754 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Brca1P48754 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Brca1P48754 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Brca1P48754 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Brca1P48754 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Brca1P48754 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Brca1P48754 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Brca1P48754 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Brca1P48754 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Brca1P48754 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Brca1P48754 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Brca1P48754 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Brca1P48754 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Brca1P48754 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Brca1P48754 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Brca1P48754 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Brca1P48754 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Brca1P48754 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Brca1P48754 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Brca1P48754 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms