Protein–RNA interactions for Protein: P47939

Resp18, Regulated endocrine-specific protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Resp18P47939 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Resp18P47939 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Resp18P47939 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Resp18P47939 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Resp18P47939 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Resp18P47939 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Resp18P47939 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Resp18P47939 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Resp18P47939 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Resp18P47939 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Resp18P47939 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Resp18P47939 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Resp18P47939 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Resp18P47939 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Resp18P47939 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Resp18P47939 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Resp18P47939 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Resp18P47939 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Resp18P47939 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Resp18P47939 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Resp18P47939 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Resp18P47939 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Resp18P47939 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Resp18P47939 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Resp18P47939 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Resp18P47939 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Resp18P47939 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Resp18P47939 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Resp18P47939 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Resp18P47939 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Resp18P47939 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Resp18P47939 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Resp18P47939 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Resp18P47939 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Resp18P47939 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Resp18P47939 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Resp18P47939 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Resp18P47939 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Resp18P47939 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Resp18P47939 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Resp18P47939 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Resp18P47939 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Resp18P47939 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Resp18P47939 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Resp18P47939 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Resp18P47939 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Resp18P47939 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Resp18P47939 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Resp18P47939 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Resp18P47939 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Resp18P47939 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Resp18P47939 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Resp18P47939 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Resp18P47939 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Resp18P47939 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Resp18P47939 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Resp18P47939 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Resp18P47939 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Resp18P47939 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Resp18P47939 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Resp18P47939 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Resp18P47939 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Resp18P47939 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Resp18P47939 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Resp18P47939 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Resp18P47939 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Resp18P47939 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Resp18P47939 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Resp18P47939 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Resp18P47939 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Resp18P47939 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Resp18P47939 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Resp18P47939 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Resp18P47939 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Resp18P47939 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Resp18P47939 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Resp18P47939 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Resp18P47939 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Resp18P47939 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Resp18P47939 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Resp18P47939 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Resp18P47939 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Resp18P47939 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Resp18P47939 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Resp18P47939 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Resp18P47939 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Resp18P47939 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Resp18P47939 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Resp18P47939 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Resp18P47939 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Resp18P47939 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Resp18P47939 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Resp18P47939 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Resp18P47939 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Resp18P47939 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Resp18P47939 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Resp18P47939 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Resp18P47939 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Resp18P47939 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Resp18P47939 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms