Protein–RNA interactions for Protein: P47242

Pax9, Paired box protein Pax-9, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax9P47242 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Pax9P47242 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pax9P47242 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pax9P47242 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pax9P47242 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pax9P47242 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pax9P47242 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pax9P47242 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pax9P47242 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Pax9P47242 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pax9P47242 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Pax9P47242 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pax9P47242 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pax9P47242 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pax9P47242 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pax9P47242 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pax9P47242 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pax9P47242 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pax9P47242 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pax9P47242 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pax9P47242 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pax9P47242 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pax9P47242 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pax9P47242 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pax9P47242 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pax9P47242 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pax9P47242 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pax9P47242 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pax9P47242 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pax9P47242 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pax9P47242 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pax9P47242 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pax9P47242 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pax9P47242 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Pax9P47242 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pax9P47242 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Pax9P47242 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pax9P47242 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pax9P47242 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pax9P47242 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pax9P47242 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pax9P47242 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pax9P47242 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pax9P47242 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pax9P47242 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pax9P47242 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pax9P47242 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pax9P47242 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pax9P47242 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pax9P47242 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pax9P47242 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pax9P47242 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pax9P47242 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pax9P47242 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pax9P47242 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pax9P47242 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pax9P47242 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pax9P47242 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pax9P47242 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pax9P47242 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pax9P47242 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pax9P47242 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pax9P47242 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pax9P47242 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pax9P47242 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pax9P47242 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pax9P47242 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pax9P47242 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pax9P47242 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pax9P47242 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pax9P47242 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pax9P47242 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pax9P47242 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pax9P47242 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Pax9P47242 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pax9P47242 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pax9P47242 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pax9P47242 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pax9P47242 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pax9P47242 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pax9P47242 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pax9P47242 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pax9P47242 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pax9P47242 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pax9P47242 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pax9P47242 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pax9P47242 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pax9P47242 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pax9P47242 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pax9P47242 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pax9P47242 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pax9P47242 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pax9P47242 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pax9P47242 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pax9P47242 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pax9P47242 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pax9P47242 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pax9P47242 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pax9P47242 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pax9P47242 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms