Protein–RNA interactions for Protein: P46737

Brcc3, Lys-63-specific deubiquitinase BRCC36, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brcc3P46737 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Brcc3P46737 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Brcc3P46737 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Brcc3P46737 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Brcc3P46737 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Brcc3P46737 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Brcc3P46737 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Brcc3P46737 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Brcc3P46737 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Brcc3P46737 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Brcc3P46737 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Brcc3P46737 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Brcc3P46737 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Brcc3P46737 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Brcc3P46737 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Brcc3P46737 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Brcc3P46737 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Brcc3P46737 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Brcc3P46737 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Brcc3P46737 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Brcc3P46737 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Brcc3P46737 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Brcc3P46737 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Brcc3P46737 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Brcc3P46737 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Brcc3P46737 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Brcc3P46737 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Brcc3P46737 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Brcc3P46737 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Brcc3P46737 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Brcc3P46737 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Brcc3P46737 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Brcc3P46737 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Brcc3P46737 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Brcc3P46737 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Brcc3P46737 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Brcc3P46737 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Brcc3P46737 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Brcc3P46737 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Brcc3P46737 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Brcc3P46737 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Brcc3P46737 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Brcc3P46737 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Brcc3P46737 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Brcc3P46737 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Brcc3P46737 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Brcc3P46737 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Brcc3P46737 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Brcc3P46737 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Brcc3P46737 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Brcc3P46737 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Brcc3P46737 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Brcc3P46737 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Brcc3P46737 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Brcc3P46737 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Brcc3P46737 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Brcc3P46737 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Brcc3P46737 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Brcc3P46737 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Brcc3P46737 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Brcc3P46737 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Brcc3P46737 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Brcc3P46737 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Brcc3P46737 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Brcc3P46737 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Brcc3P46737 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Brcc3P46737 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Brcc3P46737 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Brcc3P46737 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Brcc3P46737 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Brcc3P46737 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Brcc3P46737 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Brcc3P46737 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Brcc3P46737 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Brcc3P46737 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Brcc3P46737 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Brcc3P46737 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Brcc3P46737 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Brcc3P46737 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Brcc3P46737 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Brcc3P46737 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Brcc3P46737 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Brcc3P46737 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Brcc3P46737 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Brcc3P46737 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Brcc3P46737 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Brcc3P46737 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Brcc3P46737 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Brcc3P46737 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Brcc3P46737 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Brcc3P46737 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Brcc3P46737 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Brcc3P46737 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.27■■□□□ 1
Brcc3P46737 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Brcc3P46737 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Brcc3P46737 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Brcc3P46737 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Brcc3P46737 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Brcc3P46737 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Brcc3P46737 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms