Protein–RNA interactions for Protein: P46638

Rab11b, Ras-related protein Rab-11B, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11bP46638 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rab11bP46638 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rab11bP46638 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rab11bP46638 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rab11bP46638 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rab11bP46638 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rab11bP46638 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rab11bP46638 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rab11bP46638 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rab11bP46638 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rab11bP46638 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rab11bP46638 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rab11bP46638 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rab11bP46638 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rab11bP46638 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rab11bP46638 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rab11bP46638 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rab11bP46638 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rab11bP46638 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rab11bP46638 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rab11bP46638 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rab11bP46638 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rab11bP46638 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rab11bP46638 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rab11bP46638 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rab11bP46638 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rab11bP46638 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rab11bP46638 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rab11bP46638 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rab11bP46638 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rab11bP46638 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rab11bP46638 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rab11bP46638 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rab11bP46638 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rab11bP46638 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rab11bP46638 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rab11bP46638 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rab11bP46638 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rab11bP46638 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rab11bP46638 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rab11bP46638 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rab11bP46638 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rab11bP46638 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rab11bP46638 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rab11bP46638 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rab11bP46638 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rab11bP46638 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rab11bP46638 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Rab11bP46638 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rab11bP46638 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rab11bP46638 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rab11bP46638 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Rab11bP46638 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rab11bP46638 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rab11bP46638 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rab11bP46638 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rab11bP46638 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rab11bP46638 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rab11bP46638 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rab11bP46638 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rab11bP46638 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rab11bP46638 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rab11bP46638 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rab11bP46638 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rab11bP46638 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rab11bP46638 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rab11bP46638 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rab11bP46638 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rab11bP46638 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rab11bP46638 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rab11bP46638 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rab11bP46638 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rab11bP46638 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rab11bP46638 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rab11bP46638 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rab11bP46638 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rab11bP46638 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rab11bP46638 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rab11bP46638 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rab11bP46638 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rab11bP46638 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rab11bP46638 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rab11bP46638 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rab11bP46638 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rab11bP46638 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rab11bP46638 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rab11bP46638 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rab11bP46638 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rab11bP46638 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rab11bP46638 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rab11bP46638 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rab11bP46638 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rab11bP46638 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rab11bP46638 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rab11bP46638 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rab11bP46638 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rab11bP46638 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rab11bP46638 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rab11bP46638 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rab11bP46638 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms