Protein–RNA interactions for Protein: P46096

Syt1, Synaptotagmin-1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syt1P46096 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Syt1P46096 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Syt1P46096 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Syt1P46096 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Syt1P46096 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Syt1P46096 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Syt1P46096 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Syt1P46096 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Syt1P46096 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Syt1P46096 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Syt1P46096 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Syt1P46096 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Syt1P46096 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Syt1P46096 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Syt1P46096 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Syt1P46096 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Syt1P46096 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Syt1P46096 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Syt1P46096 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Syt1P46096 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Syt1P46096 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Syt1P46096 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Syt1P46096 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Syt1P46096 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Syt1P46096 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Syt1P46096 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Syt1P46096 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Syt1P46096 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Syt1P46096 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Syt1P46096 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Syt1P46096 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Syt1P46096 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Syt1P46096 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Syt1P46096 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Syt1P46096 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Syt1P46096 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Syt1P46096 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Syt1P46096 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Syt1P46096 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Syt1P46096 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Syt1P46096 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Syt1P46096 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Syt1P46096 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Syt1P46096 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Syt1P46096 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Syt1P46096 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Syt1P46096 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Syt1P46096 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Syt1P46096 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Syt1P46096 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Syt1P46096 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Syt1P46096 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Syt1P46096 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Syt1P46096 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Syt1P46096 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Syt1P46096 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Syt1P46096 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Syt1P46096 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Syt1P46096 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Syt1P46096 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Syt1P46096 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Syt1P46096 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Syt1P46096 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Syt1P46096 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Syt1P46096 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Syt1P46096 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Syt1P46096 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Syt1P46096 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Syt1P46096 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Syt1P46096 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Syt1P46096 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Syt1P46096 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Syt1P46096 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Syt1P46096 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Syt1P46096 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Syt1P46096 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Syt1P46096 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Syt1P46096 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Syt1P46096 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Syt1P46096 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Syt1P46096 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Syt1P46096 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Syt1P46096 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Syt1P46096 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Syt1P46096 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Syt1P46096 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Syt1P46096 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Syt1P46096 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Syt1P46096 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Syt1P46096 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Syt1P46096 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Syt1P46096 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Syt1P46096 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Syt1P46096 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Syt1P46096 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Syt1P46096 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Syt1P46096 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Syt1P46096 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Syt1P46096 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Syt1P46096 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms