Protein–RNA interactions for Protein: P43407

Sdc2, Syndecan-2, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc2P43407 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sdc2P43407 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sdc2P43407 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Sdc2P43407 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sdc2P43407 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sdc2P43407 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sdc2P43407 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sdc2P43407 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sdc2P43407 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sdc2P43407 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sdc2P43407 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sdc2P43407 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sdc2P43407 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sdc2P43407 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sdc2P43407 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sdc2P43407 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Sdc2P43407 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sdc2P43407 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sdc2P43407 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sdc2P43407 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sdc2P43407 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sdc2P43407 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sdc2P43407 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sdc2P43407 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Sdc2P43407 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sdc2P43407 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sdc2P43407 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sdc2P43407 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sdc2P43407 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sdc2P43407 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sdc2P43407 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sdc2P43407 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sdc2P43407 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sdc2P43407 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sdc2P43407 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sdc2P43407 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Sdc2P43407 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sdc2P43407 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sdc2P43407 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sdc2P43407 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sdc2P43407 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sdc2P43407 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sdc2P43407 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sdc2P43407 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sdc2P43407 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sdc2P43407 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sdc2P43407 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sdc2P43407 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sdc2P43407 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sdc2P43407 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sdc2P43407 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sdc2P43407 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sdc2P43407 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sdc2P43407 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sdc2P43407 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sdc2P43407 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sdc2P43407 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sdc2P43407 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sdc2P43407 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sdc2P43407 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sdc2P43407 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sdc2P43407 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sdc2P43407 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sdc2P43407 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sdc2P43407 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sdc2P43407 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sdc2P43407 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sdc2P43407 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sdc2P43407 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sdc2P43407 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sdc2P43407 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Sdc2P43407 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sdc2P43407 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sdc2P43407 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sdc2P43407 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sdc2P43407 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sdc2P43407 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sdc2P43407 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sdc2P43407 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sdc2P43407 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sdc2P43407 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sdc2P43407 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sdc2P43407 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sdc2P43407 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sdc2P43407 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sdc2P43407 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sdc2P43407 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sdc2P43407 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sdc2P43407 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Sdc2P43407 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sdc2P43407 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sdc2P43407 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sdc2P43407 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sdc2P43407 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sdc2P43407 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sdc2P43407 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sdc2P43407 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sdc2P43407 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sdc2P43407 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sdc2P43407 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms