Protein–RNA interactions for Protein: P42337

Pik3ca, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha isoform, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pik3caP42337 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pik3caP42337 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Pik3caP42337 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pik3caP42337 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pik3caP42337 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pik3caP42337 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pik3caP42337 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pik3caP42337 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pik3caP42337 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pik3caP42337 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pik3caP42337 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pik3caP42337 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pik3caP42337 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pik3caP42337 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pik3caP42337 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pik3caP42337 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pik3caP42337 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pik3caP42337 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pik3caP42337 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pik3caP42337 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pik3caP42337 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Pik3caP42337 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pik3caP42337 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pik3caP42337 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pik3caP42337 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pik3caP42337 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pik3caP42337 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pik3caP42337 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pik3caP42337 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pik3caP42337 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pik3caP42337 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pik3caP42337 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pik3caP42337 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pik3caP42337 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pik3caP42337 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pik3caP42337 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pik3caP42337 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pik3caP42337 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Pik3caP42337 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Pik3caP42337 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pik3caP42337 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pik3caP42337 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pik3caP42337 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pik3caP42337 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pik3caP42337 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pik3caP42337 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pik3caP42337 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pik3caP42337 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pik3caP42337 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pik3caP42337 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pik3caP42337 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pik3caP42337 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pik3caP42337 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pik3caP42337 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pik3caP42337 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pik3caP42337 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pik3caP42337 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pik3caP42337 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Pik3caP42337 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pik3caP42337 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pik3caP42337 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pik3caP42337 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Pik3caP42337 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pik3caP42337 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pik3caP42337 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pik3caP42337 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pik3caP42337 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pik3caP42337 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pik3caP42337 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pik3caP42337 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pik3caP42337 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pik3caP42337 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pik3caP42337 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Pik3caP42337 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pik3caP42337 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Pik3caP42337 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pik3caP42337 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pik3caP42337 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pik3caP42337 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pik3caP42337 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pik3caP42337 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pik3caP42337 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Pik3caP42337 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pik3caP42337 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pik3caP42337 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pik3caP42337 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pik3caP42337 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pik3caP42337 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pik3caP42337 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pik3caP42337 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pik3caP42337 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Pik3caP42337 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pik3caP42337 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pik3caP42337 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pik3caP42337 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pik3caP42337 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pik3caP42337 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pik3caP42337 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pik3caP42337 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pik3caP42337 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms