Protein–RNA interactions for Protein: P42209

Sept1, Septin-1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sept1P42209 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sept1P42209 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sept1P42209 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Sept1P42209 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sept1P42209 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sept1P42209 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sept1P42209 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sept1P42209 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sept1P42209 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sept1P42209 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sept1P42209 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sept1P42209 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sept1P42209 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sept1P42209 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sept1P42209 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sept1P42209 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sept1P42209 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sept1P42209 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sept1P42209 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sept1P42209 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sept1P42209 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sept1P42209 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sept1P42209 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Sept1P42209 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sept1P42209 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sept1P42209 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sept1P42209 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sept1P42209 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sept1P42209 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sept1P42209 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sept1P42209 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sept1P42209 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sept1P42209 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sept1P42209 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sept1P42209 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sept1P42209 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sept1P42209 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sept1P42209 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Sept1P42209 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sept1P42209 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sept1P42209 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sept1P42209 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sept1P42209 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sept1P42209 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sept1P42209 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sept1P42209 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sept1P42209 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sept1P42209 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sept1P42209 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sept1P42209 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sept1P42209 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sept1P42209 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sept1P42209 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Sept1P42209 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sept1P42209 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sept1P42209 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sept1P42209 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sept1P42209 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sept1P42209 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sept1P42209 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sept1P42209 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sept1P42209 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sept1P42209 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sept1P42209 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sept1P42209 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sept1P42209 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sept1P42209 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sept1P42209 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Sept1P42209 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sept1P42209 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sept1P42209 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sept1P42209 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sept1P42209 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sept1P42209 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sept1P42209 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sept1P42209 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sept1P42209 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sept1P42209 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sept1P42209 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sept1P42209 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sept1P42209 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sept1P42209 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sept1P42209 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Sept1P42209 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sept1P42209 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sept1P42209 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sept1P42209 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sept1P42209 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sept1P42209 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sept1P42209 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sept1P42209 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sept1P42209 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sept1P42209 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sept1P42209 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sept1P42209 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sept1P42209 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sept1P42209 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sept1P42209 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sept1P42209 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sept1P42209 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms