Protein–RNA interactions for Protein: P41539

Tac1, Protachykinin-1, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tac1P41539 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tac1P41539 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tac1P41539 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tac1P41539 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tac1P41539 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tac1P41539 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tac1P41539 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tac1P41539 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tac1P41539 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tac1P41539 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tac1P41539 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tac1P41539 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tac1P41539 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tac1P41539 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tac1P41539 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tac1P41539 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tac1P41539 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tac1P41539 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tac1P41539 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tac1P41539 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tac1P41539 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tac1P41539 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tac1P41539 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tac1P41539 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tac1P41539 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tac1P41539 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tac1P41539 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tac1P41539 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tac1P41539 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tac1P41539 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tac1P41539 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tac1P41539 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tac1P41539 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tac1P41539 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tac1P41539 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tac1P41539 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tac1P41539 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tac1P41539 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Tac1P41539 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Tac1P41539 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Tac1P41539 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Tac1P41539 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Tac1P41539 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tac1P41539 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tac1P41539 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tac1P41539 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tac1P41539 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tac1P41539 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tac1P41539 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tac1P41539 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tac1P41539 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tac1P41539 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tac1P41539 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tac1P41539 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tac1P41539 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tac1P41539 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tac1P41539 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tac1P41539 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tac1P41539 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tac1P41539 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tac1P41539 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tac1P41539 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tac1P41539 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tac1P41539 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tac1P41539 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tac1P41539 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tac1P41539 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tac1P41539 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tac1P41539 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tac1P41539 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tac1P41539 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tac1P41539 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tac1P41539 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tac1P41539 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tac1P41539 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tac1P41539 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tac1P41539 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tac1P41539 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tac1P41539 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tac1P41539 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tac1P41539 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tac1P41539 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tac1P41539 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tac1P41539 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tac1P41539 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tac1P41539 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tac1P41539 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tac1P41539 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tac1P41539 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Tac1P41539 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Tac1P41539 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tac1P41539 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tac1P41539 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tac1P41539 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tac1P41539 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tac1P41539 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tac1P41539 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tac1P41539 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tac1P41539 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tac1P41539 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms