Protein–RNA interactions for Protein: P41245

Mmp9, Matrix metalloproteinase-9, mousemouse

Predictions only

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp9P41245 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mmp9P41245 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mmp9P41245 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mmp9P41245 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Mmp9P41245 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mmp9P41245 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mmp9P41245 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mmp9P41245 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mmp9P41245 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mmp9P41245 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mmp9P41245 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mmp9P41245 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mmp9P41245 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mmp9P41245 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mmp9P41245 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mmp9P41245 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mmp9P41245 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mmp9P41245 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mmp9P41245 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mmp9P41245 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mmp9P41245 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Mmp9P41245 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mmp9P41245 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mmp9P41245 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mmp9P41245 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mmp9P41245 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mmp9P41245 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Mmp9P41245 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mmp9P41245 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mmp9P41245 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mmp9P41245 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mmp9P41245 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mmp9P41245 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mmp9P41245 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mmp9P41245 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mmp9P41245 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mmp9P41245 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mmp9P41245 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mmp9P41245 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Mmp9P41245 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Mmp9P41245 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Mmp9P41245 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mmp9P41245 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mmp9P41245 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mmp9P41245 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mmp9P41245 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mmp9P41245 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mmp9P41245 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mmp9P41245 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mmp9P41245 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mmp9P41245 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mmp9P41245 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mmp9P41245 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mmp9P41245 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mmp9P41245 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Mmp9P41245 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mmp9P41245 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mmp9P41245 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mmp9P41245 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mmp9P41245 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mmp9P41245 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mmp9P41245 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mmp9P41245 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mmp9P41245 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mmp9P41245 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mmp9P41245 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mmp9P41245 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mmp9P41245 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mmp9P41245 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mmp9P41245 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mmp9P41245 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mmp9P41245 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mmp9P41245 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mmp9P41245 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mmp9P41245 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mmp9P41245 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mmp9P41245 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mmp9P41245 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Mmp9P41245 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mmp9P41245 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mmp9P41245 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mmp9P41245 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mmp9P41245 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mmp9P41245 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mmp9P41245 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mmp9P41245 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mmp9P41245 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mmp9P41245 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mmp9P41245 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mmp9P41245 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mmp9P41245 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mmp9P41245 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mmp9P41245 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mmp9P41245 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mmp9P41245 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mmp9P41245 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Mmp9P41245 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Mmp9P41245 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mmp9P41245 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mmp9P41245 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms