Protein–RNA interactions for Protein: P39429

Traf2, TNF receptor-associated factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf2P39429 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Traf2P39429 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Traf2P39429 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Traf2P39429 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Traf2P39429 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Traf2P39429 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Traf2P39429 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Traf2P39429 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Traf2P39429 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Traf2P39429 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Traf2P39429 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Traf2P39429 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Traf2P39429 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Traf2P39429 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Traf2P39429 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Traf2P39429 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Traf2P39429 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Traf2P39429 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Traf2P39429 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Traf2P39429 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Traf2P39429 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Traf2P39429 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Traf2P39429 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Traf2P39429 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Traf2P39429 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Traf2P39429 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Traf2P39429 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Traf2P39429 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Traf2P39429 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Traf2P39429 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Traf2P39429 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Traf2P39429 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Traf2P39429 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Traf2P39429 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Traf2P39429 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Traf2P39429 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Traf2P39429 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Traf2P39429 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Traf2P39429 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Traf2P39429 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Traf2P39429 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Traf2P39429 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Traf2P39429 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Traf2P39429 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Traf2P39429 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Traf2P39429 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Traf2P39429 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Traf2P39429 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Traf2P39429 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Traf2P39429 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Traf2P39429 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Traf2P39429 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Traf2P39429 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Traf2P39429 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Traf2P39429 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Traf2P39429 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Traf2P39429 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Traf2P39429 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Traf2P39429 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Traf2P39429 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Traf2P39429 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Traf2P39429 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Traf2P39429 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Traf2P39429 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Traf2P39429 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Traf2P39429 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Traf2P39429 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Traf2P39429 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Traf2P39429 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Traf2P39429 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Traf2P39429 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Traf2P39429 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Traf2P39429 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Traf2P39429 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Traf2P39429 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Traf2P39429 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Traf2P39429 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Traf2P39429 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Traf2P39429 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Traf2P39429 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Traf2P39429 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Traf2P39429 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Traf2P39429 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Traf2P39429 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Traf2P39429 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Traf2P39429 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Traf2P39429 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Traf2P39429 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Traf2P39429 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Traf2P39429 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Traf2P39429 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Traf2P39429 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Traf2P39429 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Traf2P39429 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Traf2P39429 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Traf2P39429 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Traf2P39429 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Traf2P39429 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Traf2P39429 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Traf2P39429 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms