Protein–RNA interactions for Protein: P35821

Ptpn1, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 1, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn1P35821 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ptpn1P35821 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ptpn1P35821 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ptpn1P35821 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ptpn1P35821 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ptpn1P35821 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ptpn1P35821 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ptpn1P35821 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ptpn1P35821 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ptpn1P35821 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ptpn1P35821 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ptpn1P35821 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ptpn1P35821 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ptpn1P35821 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ptpn1P35821 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ptpn1P35821 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ptpn1P35821 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ptpn1P35821 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ptpn1P35821 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ptpn1P35821 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ptpn1P35821 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ptpn1P35821 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ptpn1P35821 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ptpn1P35821 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ptpn1P35821 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ptpn1P35821 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ptpn1P35821 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ptpn1P35821 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ptpn1P35821 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ptpn1P35821 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ptpn1P35821 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ptpn1P35821 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Ptpn1P35821 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ptpn1P35821 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ptpn1P35821 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ptpn1P35821 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ptpn1P35821 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ptpn1P35821 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ptpn1P35821 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ptpn1P35821 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ptpn1P35821 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ptpn1P35821 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ptpn1P35821 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ptpn1P35821 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ptpn1P35821 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ptpn1P35821 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ptpn1P35821 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ptpn1P35821 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ptpn1P35821 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ptpn1P35821 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ptpn1P35821 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ptpn1P35821 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ptpn1P35821 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ptpn1P35821 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ptpn1P35821 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ptpn1P35821 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ptpn1P35821 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ptpn1P35821 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ptpn1P35821 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ptpn1P35821 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ptpn1P35821 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ptpn1P35821 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ptpn1P35821 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ptpn1P35821 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ptpn1P35821 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ptpn1P35821 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ptpn1P35821 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ptpn1P35821 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ptpn1P35821 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ptpn1P35821 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ptpn1P35821 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ptpn1P35821 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ptpn1P35821 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ptpn1P35821 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ptpn1P35821 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ptpn1P35821 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ptpn1P35821 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ptpn1P35821 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ptpn1P35821 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ptpn1P35821 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ptpn1P35821 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ptpn1P35821 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ptpn1P35821 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ptpn1P35821 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ptpn1P35821 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ptpn1P35821 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ptpn1P35821 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ptpn1P35821 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ptpn1P35821 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ptpn1P35821 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ptpn1P35821 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ptpn1P35821 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ptpn1P35821 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ptpn1P35821 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ptpn1P35821 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ptpn1P35821 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ptpn1P35821 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ptpn1P35821 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ptpn1P35821 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ptpn1P35821 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms