Protein–RNA interactions for Protein: P35737

H2-DMb1, Class II histocompatibility antigen, M beta 1 chain, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-DMb1P35737 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-DMb1P35737 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-DMb1P35737 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-DMb1P35737 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-DMb1P35737 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-DMb1P35737 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-DMb1P35737 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-DMb1P35737 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-DMb1P35737 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-DMb1P35737 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-DMb1P35737 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-DMb1P35737 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-DMb1P35737 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-DMb1P35737 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-DMb1P35737 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-DMb1P35737 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-DMb1P35737 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-DMb1P35737 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-DMb1P35737 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-DMb1P35737 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-DMb1P35737 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-DMb1P35737 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-DMb1P35737 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-DMb1P35737 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-DMb1P35737 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-DMb1P35737 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-DMb1P35737 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-DMb1P35737 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-DMb1P35737 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-DMb1P35737 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-DMb1P35737 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-DMb1P35737 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-DMb1P35737 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-DMb1P35737 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-DMb1P35737 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-DMb1P35737 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-DMb1P35737 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-DMb1P35737 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-DMb1P35737 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-DMb1P35737 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-DMb1P35737 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-DMb1P35737 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-DMb1P35737 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2-DMb1P35737 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2-DMb1P35737 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2-DMb1P35737 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
H2-DMb1P35737 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2-DMb1P35737 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
H2-DMb1P35737 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2-DMb1P35737 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2-DMb1P35737 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2-DMb1P35737 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
H2-DMb1P35737 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
H2-DMb1P35737 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
H2-DMb1P35737 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
H2-DMb1P35737 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-DMb1P35737 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-DMb1P35737 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-DMb1P35737 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-DMb1P35737 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-DMb1P35737 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-DMb1P35737 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-DMb1P35737 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-DMb1P35737 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-DMb1P35737 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-DMb1P35737 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-DMb1P35737 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-DMb1P35737 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-DMb1P35737 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-DMb1P35737 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-DMb1P35737 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-DMb1P35737 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-DMb1P35737 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-DMb1P35737 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-DMb1P35737 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-DMb1P35737 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-DMb1P35737 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-DMb1P35737 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-DMb1P35737 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-DMb1P35737 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-DMb1P35737 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-DMb1P35737 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-DMb1P35737 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-DMb1P35737 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-DMb1P35737 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-DMb1P35737 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-DMb1P35737 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-DMb1P35737 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-DMb1P35737 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-DMb1P35737 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-DMb1P35737 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-DMb1P35737 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-DMb1P35737 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-DMb1P35737 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-DMb1P35737 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-DMb1P35737 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-DMb1P35737 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-DMb1P35737 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-DMb1P35737 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-DMb1P35737 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.1 ms