Protein–RNA interactions for Protein: P35601

Rfc1, Replication factor C subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfc1P35601 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rfc1P35601 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rfc1P35601 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rfc1P35601 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rfc1P35601 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rfc1P35601 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rfc1P35601 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rfc1P35601 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rfc1P35601 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rfc1P35601 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rfc1P35601 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rfc1P35601 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rfc1P35601 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rfc1P35601 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rfc1P35601 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Rfc1P35601 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rfc1P35601 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rfc1P35601 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rfc1P35601 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rfc1P35601 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rfc1P35601 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rfc1P35601 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rfc1P35601 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rfc1P35601 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rfc1P35601 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rfc1P35601 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rfc1P35601 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Rfc1P35601 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rfc1P35601 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rfc1P35601 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rfc1P35601 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rfc1P35601 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rfc1P35601 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rfc1P35601 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rfc1P35601 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rfc1P35601 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rfc1P35601 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rfc1P35601 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rfc1P35601 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rfc1P35601 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rfc1P35601 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rfc1P35601 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rfc1P35601 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rfc1P35601 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rfc1P35601 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rfc1P35601 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rfc1P35601 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rfc1P35601 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rfc1P35601 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rfc1P35601 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rfc1P35601 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rfc1P35601 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rfc1P35601 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rfc1P35601 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rfc1P35601 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rfc1P35601 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rfc1P35601 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rfc1P35601 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rfc1P35601 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rfc1P35601 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rfc1P35601 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rfc1P35601 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rfc1P35601 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rfc1P35601 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rfc1P35601 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rfc1P35601 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rfc1P35601 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rfc1P35601 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rfc1P35601 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rfc1P35601 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rfc1P35601 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rfc1P35601 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rfc1P35601 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rfc1P35601 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rfc1P35601 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rfc1P35601 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rfc1P35601 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rfc1P35601 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rfc1P35601 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rfc1P35601 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rfc1P35601 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rfc1P35601 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rfc1P35601 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Rfc1P35601 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Rfc1P35601 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rfc1P35601 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rfc1P35601 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Rfc1P35601 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Rfc1P35601 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rfc1P35601 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rfc1P35601 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rfc1P35601 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rfc1P35601 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rfc1P35601 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rfc1P35601 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rfc1P35601 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rfc1P35601 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rfc1P35601 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rfc1P35601 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rfc1P35601 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms