Protein–RNA interactions for Protein: P31996

Cd68, Macrosialin, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd68P31996 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Cd68P31996 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cd68P31996 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cd68P31996 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cd68P31996 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cd68P31996 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cd68P31996 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cd68P31996 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cd68P31996 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Cd68P31996 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cd68P31996 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cd68P31996 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cd68P31996 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cd68P31996 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cd68P31996 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cd68P31996 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cd68P31996 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cd68P31996 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cd68P31996 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cd68P31996 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cd68P31996 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cd68P31996 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cd68P31996 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cd68P31996 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cd68P31996 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cd68P31996 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cd68P31996 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cd68P31996 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cd68P31996 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cd68P31996 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cd68P31996 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cd68P31996 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cd68P31996 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cd68P31996 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cd68P31996 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cd68P31996 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cd68P31996 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cd68P31996 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Cd68P31996 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cd68P31996 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cd68P31996 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cd68P31996 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cd68P31996 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cd68P31996 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cd68P31996 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cd68P31996 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Cd68P31996 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cd68P31996 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cd68P31996 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cd68P31996 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cd68P31996 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cd68P31996 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cd68P31996 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cd68P31996 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cd68P31996 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cd68P31996 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cd68P31996 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cd68P31996 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cd68P31996 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Cd68P31996 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cd68P31996 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cd68P31996 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cd68P31996 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cd68P31996 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cd68P31996 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cd68P31996 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cd68P31996 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cd68P31996 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cd68P31996 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cd68P31996 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cd68P31996 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Cd68P31996 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cd68P31996 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cd68P31996 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cd68P31996 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cd68P31996 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cd68P31996 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cd68P31996 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cd68P31996 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cd68P31996 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cd68P31996 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cd68P31996 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cd68P31996 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cd68P31996 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cd68P31996 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cd68P31996 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cd68P31996 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cd68P31996 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cd68P31996 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cd68P31996 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cd68P31996 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cd68P31996 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cd68P31996 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Cd68P31996 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Cd68P31996 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cd68P31996 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cd68P31996 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cd68P31996 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Cd68P31996 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cd68P31996 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms