Protein–RNA interactions for Protein: P31311

Hoxa11, Homeobox protein Hox-A11, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa11P31311 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hoxa11P31311 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hoxa11P31311 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hoxa11P31311 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hoxa11P31311 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hoxa11P31311 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hoxa11P31311 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hoxa11P31311 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hoxa11P31311 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hoxa11P31311 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hoxa11P31311 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hoxa11P31311 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hoxa11P31311 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hoxa11P31311 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hoxa11P31311 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hoxa11P31311 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hoxa11P31311 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hoxa11P31311 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hoxa11P31311 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hoxa11P31311 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hoxa11P31311 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hoxa11P31311 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Hoxa11P31311 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hoxa11P31311 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hoxa11P31311 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hoxa11P31311 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hoxa11P31311 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hoxa11P31311 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hoxa11P31311 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hoxa11P31311 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hoxa11P31311 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Hoxa11P31311 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hoxa11P31311 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hoxa11P31311 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hoxa11P31311 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hoxa11P31311 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hoxa11P31311 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hoxa11P31311 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hoxa11P31311 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hoxa11P31311 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hoxa11P31311 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hoxa11P31311 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hoxa11P31311 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hoxa11P31311 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Hoxa11P31311 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hoxa11P31311 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hoxa11P31311 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hoxa11P31311 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hoxa11P31311 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hoxa11P31311 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hoxa11P31311 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hoxa11P31311 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hoxa11P31311 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hoxa11P31311 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hoxa11P31311 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hoxa11P31311 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hoxa11P31311 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hoxa11P31311 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hoxa11P31311 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hoxa11P31311 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hoxa11P31311 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hoxa11P31311 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hoxa11P31311 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hoxa11P31311 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hoxa11P31311 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hoxa11P31311 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hoxa11P31311 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hoxa11P31311 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hoxa11P31311 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hoxa11P31311 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hoxa11P31311 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hoxa11P31311 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hoxa11P31311 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hoxa11P31311 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hoxa11P31311 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hoxa11P31311 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hoxa11P31311 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hoxa11P31311 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hoxa11P31311 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hoxa11P31311 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hoxa11P31311 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hoxa11P31311 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hoxa11P31311 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hoxa11P31311 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Hoxa11P31311 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hoxa11P31311 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hoxa11P31311 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hoxa11P31311 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hoxa11P31311 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hoxa11P31311 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hoxa11P31311 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hoxa11P31311 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hoxa11P31311 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hoxa11P31311 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hoxa11P31311 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hoxa11P31311 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hoxa11P31311 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hoxa11P31311 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hoxa11P31311 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hoxa11P31311 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.8 ms