Protein–RNA interactions for Protein: P30658

Cbx2, Chromobox protein homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx2P30658 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cbx2P30658 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cbx2P30658 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cbx2P30658 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cbx2P30658 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cbx2P30658 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cbx2P30658 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cbx2P30658 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cbx2P30658 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cbx2P30658 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cbx2P30658 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cbx2P30658 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cbx2P30658 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cbx2P30658 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cbx2P30658 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cbx2P30658 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cbx2P30658 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cbx2P30658 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cbx2P30658 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cbx2P30658 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cbx2P30658 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cbx2P30658 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cbx2P30658 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cbx2P30658 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cbx2P30658 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cbx2P30658 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cbx2P30658 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cbx2P30658 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cbx2P30658 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cbx2P30658 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Cbx2P30658 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cbx2P30658 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cbx2P30658 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Cbx2P30658 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cbx2P30658 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cbx2P30658 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cbx2P30658 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cbx2P30658 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cbx2P30658 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cbx2P30658 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cbx2P30658 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cbx2P30658 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cbx2P30658 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cbx2P30658 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cbx2P30658 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cbx2P30658 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cbx2P30658 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cbx2P30658 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Cbx2P30658 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cbx2P30658 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cbx2P30658 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cbx2P30658 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cbx2P30658 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cbx2P30658 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cbx2P30658 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cbx2P30658 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cbx2P30658 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cbx2P30658 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cbx2P30658 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cbx2P30658 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Cbx2P30658 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cbx2P30658 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cbx2P30658 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cbx2P30658 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cbx2P30658 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cbx2P30658 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cbx2P30658 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cbx2P30658 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cbx2P30658 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cbx2P30658 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cbx2P30658 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cbx2P30658 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cbx2P30658 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cbx2P30658 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cbx2P30658 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cbx2P30658 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cbx2P30658 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cbx2P30658 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cbx2P30658 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cbx2P30658 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cbx2P30658 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Cbx2P30658 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cbx2P30658 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cbx2P30658 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cbx2P30658 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cbx2P30658 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cbx2P30658 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cbx2P30658 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cbx2P30658 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cbx2P30658 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cbx2P30658 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cbx2P30658 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cbx2P30658 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cbx2P30658 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cbx2P30658 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cbx2P30658 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Cbx2P30658 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cbx2P30658 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cbx2P30658 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cbx2P30658 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms