Protein–RNA interactions for Protein: P29788

Vtn, Vitronectin, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VtnP29788 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VtnP29788 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VtnP29788 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
VtnP29788 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VtnP29788 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
VtnP29788 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VtnP29788 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VtnP29788 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VtnP29788 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VtnP29788 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VtnP29788 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
VtnP29788 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VtnP29788 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
VtnP29788 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VtnP29788 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VtnP29788 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VtnP29788 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VtnP29788 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VtnP29788 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VtnP29788 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VtnP29788 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VtnP29788 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VtnP29788 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VtnP29788 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VtnP29788 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VtnP29788 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VtnP29788 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VtnP29788 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VtnP29788 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VtnP29788 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
VtnP29788 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VtnP29788 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
VtnP29788 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
VtnP29788 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VtnP29788 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
VtnP29788 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VtnP29788 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VtnP29788 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VtnP29788 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VtnP29788 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VtnP29788 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VtnP29788 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VtnP29788 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
VtnP29788 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VtnP29788 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VtnP29788 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VtnP29788 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VtnP29788 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VtnP29788 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VtnP29788 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VtnP29788 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VtnP29788 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VtnP29788 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
VtnP29788 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VtnP29788 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VtnP29788 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VtnP29788 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VtnP29788 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VtnP29788 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VtnP29788 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VtnP29788 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VtnP29788 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
VtnP29788 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VtnP29788 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VtnP29788 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VtnP29788 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VtnP29788 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VtnP29788 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VtnP29788 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VtnP29788 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VtnP29788 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
VtnP29788 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VtnP29788 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VtnP29788 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VtnP29788 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VtnP29788 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VtnP29788 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VtnP29788 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VtnP29788 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VtnP29788 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VtnP29788 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VtnP29788 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VtnP29788 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VtnP29788 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
VtnP29788 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VtnP29788 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VtnP29788 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VtnP29788 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VtnP29788 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VtnP29788 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VtnP29788 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VtnP29788 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VtnP29788 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VtnP29788 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VtnP29788 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VtnP29788 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VtnP29788 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VtnP29788 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VtnP29788 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VtnP29788 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms