Protein–RNA interactions for Protein: P28654

Dcn, Decorin, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DcnP28654 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DcnP28654 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DcnP28654 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DcnP28654 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DcnP28654 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DcnP28654 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
DcnP28654 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DcnP28654 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DcnP28654 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DcnP28654 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
DcnP28654 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
DcnP28654 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
DcnP28654 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DcnP28654 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DcnP28654 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DcnP28654 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DcnP28654 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DcnP28654 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DcnP28654 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DcnP28654 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DcnP28654 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DcnP28654 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DcnP28654 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DcnP28654 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DcnP28654 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DcnP28654 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DcnP28654 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DcnP28654 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DcnP28654 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DcnP28654 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DcnP28654 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DcnP28654 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DcnP28654 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DcnP28654 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DcnP28654 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DcnP28654 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DcnP28654 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DcnP28654 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DcnP28654 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DcnP28654 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DcnP28654 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DcnP28654 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DcnP28654 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DcnP28654 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DcnP28654 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
DcnP28654 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DcnP28654 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DcnP28654 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DcnP28654 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DcnP28654 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DcnP28654 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DcnP28654 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DcnP28654 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DcnP28654 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
DcnP28654 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DcnP28654 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DcnP28654 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DcnP28654 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DcnP28654 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DcnP28654 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DcnP28654 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DcnP28654 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DcnP28654 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DcnP28654 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DcnP28654 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
DcnP28654 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DcnP28654 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DcnP28654 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DcnP28654 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DcnP28654 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DcnP28654 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DcnP28654 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DcnP28654 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DcnP28654 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DcnP28654 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DcnP28654 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DcnP28654 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DcnP28654 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DcnP28654 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DcnP28654 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DcnP28654 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DcnP28654 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DcnP28654 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DcnP28654 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DcnP28654 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
DcnP28654 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DcnP28654 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DcnP28654 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DcnP28654 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DcnP28654 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DcnP28654 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DcnP28654 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DcnP28654 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DcnP28654 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DcnP28654 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DcnP28654 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DcnP28654 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DcnP28654 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DcnP28654 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DcnP28654 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms