Protein–RNA interactions for Protein: P28481

Col2a1, Collagen alpha-1(II) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col2a1P28481 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Col2a1P28481 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Col2a1P28481 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Col2a1P28481 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Col2a1P28481 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Col2a1P28481 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Col2a1P28481 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Col2a1P28481 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Col2a1P28481 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Col2a1P28481 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Col2a1P28481 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Col2a1P28481 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Col2a1P28481 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Col2a1P28481 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Col2a1P28481 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Col2a1P28481 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Col2a1P28481 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Col2a1P28481 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Col2a1P28481 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Col2a1P28481 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Col2a1P28481 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Col2a1P28481 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Col2a1P28481 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Col2a1P28481 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Col2a1P28481 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Col2a1P28481 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Col2a1P28481 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Col2a1P28481 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Col2a1P28481 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Col2a1P28481 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Col2a1P28481 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Col2a1P28481 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Col2a1P28481 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Col2a1P28481 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Col2a1P28481 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Col2a1P28481 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Col2a1P28481 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Col2a1P28481 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Col2a1P28481 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Col2a1P28481 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Col2a1P28481 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Col2a1P28481 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Col2a1P28481 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Col2a1P28481 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Col2a1P28481 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Col2a1P28481 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Col2a1P28481 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Col2a1P28481 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Col2a1P28481 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Col2a1P28481 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Col2a1P28481 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Col2a1P28481 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Col2a1P28481 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Col2a1P28481 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Col2a1P28481 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Col2a1P28481 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Col2a1P28481 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Col2a1P28481 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Col2a1P28481 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Col2a1P28481 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Col2a1P28481 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Col2a1P28481 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Col2a1P28481 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Col2a1P28481 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Col2a1P28481 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Col2a1P28481 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Col2a1P28481 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Col2a1P28481 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Col2a1P28481 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Col2a1P28481 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Col2a1P28481 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Col2a1P28481 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Col2a1P28481 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Col2a1P28481 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Col2a1P28481 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Col2a1P28481 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Col2a1P28481 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Col2a1P28481 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Col2a1P28481 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Col2a1P28481 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Col2a1P28481 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Col2a1P28481 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Col2a1P28481 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Col2a1P28481 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Col2a1P28481 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Col2a1P28481 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Col2a1P28481 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Col2a1P28481 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Col2a1P28481 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Col2a1P28481 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Col2a1P28481 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Col2a1P28481 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Col2a1P28481 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Col2a1P28481 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Col2a1P28481 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Col2a1P28481 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Col2a1P28481 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Col2a1P28481 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Col2a1P28481 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Col2a1P28481 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms