Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hoxd10P28359 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hoxd10P28359 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hoxd10P28359 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hoxd10P28359 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hoxd10P28359 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hoxd10P28359 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hoxd10P28359 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hoxd10P28359 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hoxd10P28359 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hoxd10P28359 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hoxd10P28359 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hoxd10P28359 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Hoxd10P28359 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Hoxd10P28359 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hoxd10P28359 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hoxd10P28359 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hoxd10P28359 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hoxd10P28359 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hoxd10P28359 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hoxd10P28359 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hoxd10P28359 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hoxd10P28359 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Hoxd10P28359 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Hoxd10P28359 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hoxd10P28359 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hoxd10P28359 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hoxd10P28359 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hoxd10P28359 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Hoxd10P28359 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Hoxd10P28359 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Hoxd10P28359 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hoxd10P28359 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hoxd10P28359 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hoxd10P28359 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hoxd10P28359 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hoxd10P28359 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hoxd10P28359 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hoxd10P28359 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hoxd10P28359 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hoxd10P28359 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hoxd10P28359 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Hoxd10P28359 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hoxd10P28359 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hoxd10P28359 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hoxd10P28359 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hoxd10P28359 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Hoxd10P28359 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hoxd10P28359 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hoxd10P28359 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hoxd10P28359 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hoxd10P28359 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hoxd10P28359 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hoxd10P28359 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Hoxd10P28359 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Hoxd10P28359 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hoxd10P28359 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hoxd10P28359 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hoxd10P28359 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hoxd10P28359 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hoxd10P28359 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hoxd10P28359 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hoxd10P28359 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hoxd10P28359 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Hoxd10P28359 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hoxd10P28359 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hoxd10P28359 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hoxd10P28359 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hoxd10P28359 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hoxd10P28359 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hoxd10P28359 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hoxd10P28359 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hoxd10P28359 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hoxd10P28359 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hoxd10P28359 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hoxd10P28359 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hoxd10P28359 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Hoxd10P28359 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hoxd10P28359 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Hoxd10P28359 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hoxd10P28359 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hoxd10P28359 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hoxd10P28359 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hoxd10P28359 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hoxd10P28359 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Hoxd10P28359 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Hoxd10P28359 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hoxd10P28359 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hoxd10P28359 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hoxd10P28359 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hoxd10P28359 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hoxd10P28359 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hoxd10P28359 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Hoxd10P28359 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hoxd10P28359 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hoxd10P28359 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hoxd10P28359 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hoxd10P28359 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hoxd10P28359 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hoxd10P28359 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms