Protein–RNA interactions for Protein: P28312

Defa5, Alpha-defensin 5, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa5P28312 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Defa5P28312 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Defa5P28312 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Defa5P28312 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Defa5P28312 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Defa5P28312 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Defa5P28312 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Defa5P28312 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Defa5P28312 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Defa5P28312 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Defa5P28312 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Defa5P28312 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Defa5P28312 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Defa5P28312 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Defa5P28312 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Defa5P28312 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Defa5P28312 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Defa5P28312 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Defa5P28312 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Defa5P28312 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Defa5P28312 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Defa5P28312 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Defa5P28312 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Defa5P28312 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Defa5P28312 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Defa5P28312 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Defa5P28312 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Defa5P28312 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Defa5P28312 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Defa5P28312 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Defa5P28312 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Defa5P28312 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Defa5P28312 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Defa5P28312 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Defa5P28312 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Defa5P28312 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Defa5P28312 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Defa5P28312 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Defa5P28312 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Defa5P28312 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Defa5P28312 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Defa5P28312 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Defa5P28312 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Defa5P28312 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Defa5P28312 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Defa5P28312 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Defa5P28312 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Defa5P28312 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Defa5P28312 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Defa5P28312 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Defa5P28312 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Defa5P28312 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Defa5P28312 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Defa5P28312 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Defa5P28312 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Defa5P28312 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Defa5P28312 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Defa5P28312 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Defa5P28312 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Defa5P28312 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Defa5P28312 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Defa5P28312 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Defa5P28312 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Defa5P28312 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Defa5P28312 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Defa5P28312 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Defa5P28312 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Defa5P28312 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Defa5P28312 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Defa5P28312 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Defa5P28312 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Defa5P28312 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Defa5P28312 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Defa5P28312 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Defa5P28312 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Defa5P28312 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Defa5P28312 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Defa5P28312 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Defa5P28312 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Defa5P28312 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Defa5P28312 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Defa5P28312 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Defa5P28312 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Defa5P28312 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Defa5P28312 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Defa5P28312 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Defa5P28312 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Defa5P28312 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Defa5P28312 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Defa5P28312 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Defa5P28312 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Defa5P28312 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Defa5P28312 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Defa5P28312 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Defa5P28312 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Defa5P28312 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Defa5P28312 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Defa5P28312 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Defa5P28312 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Defa5P28312 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms