Protein–RNA interactions for Protein: P28271

Aco1, Cytoplasmic aconitate hydratase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aco1P28271 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Aco1P28271 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Aco1P28271 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Aco1P28271 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Aco1P28271 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Aco1P28271 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Aco1P28271 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Aco1P28271 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Aco1P28271 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Aco1P28271 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Aco1P28271 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Aco1P28271 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Aco1P28271 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Aco1P28271 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Aco1P28271 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Aco1P28271 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Aco1P28271 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Aco1P28271 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Aco1P28271 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Aco1P28271 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Aco1P28271 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Aco1P28271 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Aco1P28271 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Aco1P28271 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Aco1P28271 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Aco1P28271 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Aco1P28271 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Aco1P28271 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Aco1P28271 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Aco1P28271 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Aco1P28271 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Aco1P28271 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Aco1P28271 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Aco1P28271 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Aco1P28271 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Aco1P28271 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Aco1P28271 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Aco1P28271 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Aco1P28271 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Aco1P28271 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Aco1P28271 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Aco1P28271 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Aco1P28271 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Aco1P28271 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Aco1P28271 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Aco1P28271 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Aco1P28271 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Aco1P28271 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Aco1P28271 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Aco1P28271 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Aco1P28271 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Aco1P28271 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Aco1P28271 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Aco1P28271 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Aco1P28271 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Aco1P28271 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Aco1P28271 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Aco1P28271 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Aco1P28271 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Aco1P28271 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Aco1P28271 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Aco1P28271 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Aco1P28271 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Aco1P28271 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Aco1P28271 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Aco1P28271 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Aco1P28271 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Aco1P28271 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Aco1P28271 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Aco1P28271 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Aco1P28271 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Aco1P28271 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Aco1P28271 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Aco1P28271 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Aco1P28271 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Aco1P28271 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Aco1P28271 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Aco1P28271 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Aco1P28271 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Aco1P28271 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Aco1P28271 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Aco1P28271 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Aco1P28271 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Aco1P28271 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Aco1P28271 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Aco1P28271 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Aco1P28271 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Aco1P28271 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Aco1P28271 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Aco1P28271 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Aco1P28271 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Aco1P28271 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Aco1P28271 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Aco1P28271 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Aco1P28271 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Aco1P28271 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Aco1P28271 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Aco1P28271 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Aco1P28271 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Aco1P28271 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms