Protein–RNA interactions for Protein: P28231

Gjb3, Gap junction beta-3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb3P28231 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gjb3P28231 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gjb3P28231 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gjb3P28231 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Gjb3P28231 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gjb3P28231 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Gjb3P28231 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Gjb3P28231 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gjb3P28231 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gjb3P28231 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gjb3P28231 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gjb3P28231 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gjb3P28231 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Gjb3P28231 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Gjb3P28231 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gjb3P28231 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gjb3P28231 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gjb3P28231 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gjb3P28231 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gjb3P28231 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gjb3P28231 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gjb3P28231 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gjb3P28231 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Gjb3P28231 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Gjb3P28231 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gjb3P28231 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Gjb3P28231 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Gjb3P28231 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gjb3P28231 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Gjb3P28231 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Gjb3P28231 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gjb3P28231 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gjb3P28231 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gjb3P28231 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gjb3P28231 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gjb3P28231 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gjb3P28231 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gjb3P28231 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gjb3P28231 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gjb3P28231 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gjb3P28231 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gjb3P28231 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gjb3P28231 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gjb3P28231 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gjb3P28231 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gjb3P28231 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gjb3P28231 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Gjb3P28231 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gjb3P28231 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gjb3P28231 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gjb3P28231 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gjb3P28231 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gjb3P28231 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gjb3P28231 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gjb3P28231 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gjb3P28231 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gjb3P28231 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gjb3P28231 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gjb3P28231 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gjb3P28231 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gjb3P28231 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Gjb3P28231 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gjb3P28231 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gjb3P28231 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gjb3P28231 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gjb3P28231 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gjb3P28231 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gjb3P28231 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gjb3P28231 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gjb3P28231 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gjb3P28231 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gjb3P28231 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gjb3P28231 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gjb3P28231 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Gjb3P28231 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gjb3P28231 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gjb3P28231 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gjb3P28231 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gjb3P28231 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gjb3P28231 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gjb3P28231 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gjb3P28231 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gjb3P28231 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gjb3P28231 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gjb3P28231 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gjb3P28231 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gjb3P28231 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gjb3P28231 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gjb3P28231 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gjb3P28231 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gjb3P28231 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gjb3P28231 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gjb3P28231 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gjb3P28231 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gjb3P28231 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gjb3P28231 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gjb3P28231 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gjb3P28231 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gjb3P28231 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gjb3P28231 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms