Protein–RNA interactions for Protein: P28078

H2-DMa, Class II histocompatibility antigen, M alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-DMaP28078 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
H2-DMaP28078 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
H2-DMaP28078 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
H2-DMaP28078 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
H2-DMaP28078 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2-DMaP28078 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2-DMaP28078 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2-DMaP28078 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2-DMaP28078 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2-DMaP28078 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2-DMaP28078 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2-DMaP28078 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2-DMaP28078 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2-DMaP28078 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2-DMaP28078 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2-DMaP28078 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
H2-DMaP28078 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
H2-DMaP28078 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
H2-DMaP28078 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
H2-DMaP28078 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
H2-DMaP28078 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
H2-DMaP28078 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
H2-DMaP28078 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
H2-DMaP28078 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
H2-DMaP28078 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
H2-DMaP28078 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
H2-DMaP28078 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
H2-DMaP28078 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
H2-DMaP28078 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
H2-DMaP28078 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
H2-DMaP28078 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
H2-DMaP28078 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
H2-DMaP28078 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
H2-DMaP28078 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
H2-DMaP28078 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
H2-DMaP28078 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
H2-DMaP28078 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
H2-DMaP28078 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
H2-DMaP28078 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
H2-DMaP28078 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
H2-DMaP28078 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
H2-DMaP28078 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
H2-DMaP28078 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
H2-DMaP28078 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
H2-DMaP28078 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
H2-DMaP28078 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
H2-DMaP28078 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
H2-DMaP28078 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
H2-DMaP28078 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
H2-DMaP28078 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
H2-DMaP28078 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
H2-DMaP28078 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
H2-DMaP28078 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
H2-DMaP28078 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
H2-DMaP28078 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
H2-DMaP28078 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
H2-DMaP28078 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
H2-DMaP28078 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
H2-DMaP28078 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
H2-DMaP28078 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
H2-DMaP28078 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
H2-DMaP28078 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
H2-DMaP28078 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
H2-DMaP28078 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
H2-DMaP28078 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
H2-DMaP28078 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
H2-DMaP28078 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
H2-DMaP28078 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
H2-DMaP28078 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
H2-DMaP28078 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
H2-DMaP28078 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
H2-DMaP28078 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
H2-DMaP28078 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
H2-DMaP28078 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
H2-DMaP28078 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
H2-DMaP28078 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
H2-DMaP28078 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
H2-DMaP28078 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
H2-DMaP28078 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
H2-DMaP28078 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
H2-DMaP28078 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
H2-DMaP28078 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
H2-DMaP28078 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
H2-DMaP28078 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
H2-DMaP28078 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
H2-DMaP28078 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
H2-DMaP28078 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
H2-DMaP28078 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
H2-DMaP28078 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
H2-DMaP28078 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
H2-DMaP28078 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
H2-DMaP28078 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
H2-DMaP28078 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
H2-DMaP28078 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
H2-DMaP28078 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2-DMaP28078 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
H2-DMaP28078 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2-DMaP28078 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2-DMaP28078 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2-DMaP28078 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms