Protein–RNA interactions for Protein: P27659

Rpl3, 60S ribosomal protein L3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl3P27659 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rpl3P27659 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rpl3P27659 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rpl3P27659 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rpl3P27659 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rpl3P27659 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rpl3P27659 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rpl3P27659 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rpl3P27659 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rpl3P27659 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rpl3P27659 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rpl3P27659 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rpl3P27659 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rpl3P27659 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rpl3P27659 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rpl3P27659 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rpl3P27659 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rpl3P27659 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rpl3P27659 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rpl3P27659 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rpl3P27659 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rpl3P27659 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rpl3P27659 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rpl3P27659 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rpl3P27659 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rpl3P27659 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rpl3P27659 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rpl3P27659 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rpl3P27659 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rpl3P27659 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rpl3P27659 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rpl3P27659 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rpl3P27659 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rpl3P27659 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rpl3P27659 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rpl3P27659 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rpl3P27659 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rpl3P27659 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rpl3P27659 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rpl3P27659 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rpl3P27659 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rpl3P27659 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rpl3P27659 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rpl3P27659 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rpl3P27659 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rpl3P27659 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rpl3P27659 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rpl3P27659 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rpl3P27659 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rpl3P27659 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rpl3P27659 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rpl3P27659 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rpl3P27659 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rpl3P27659 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rpl3P27659 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Rpl3P27659 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Rpl3P27659 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rpl3P27659 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rpl3P27659 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rpl3P27659 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rpl3P27659 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rpl3P27659 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rpl3P27659 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rpl3P27659 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rpl3P27659 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rpl3P27659 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rpl3P27659 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rpl3P27659 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rpl3P27659 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rpl3P27659 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rpl3P27659 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rpl3P27659 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rpl3P27659 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rpl3P27659 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rpl3P27659 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rpl3P27659 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rpl3P27659 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rpl3P27659 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rpl3P27659 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rpl3P27659 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rpl3P27659 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rpl3P27659 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rpl3P27659 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rpl3P27659 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rpl3P27659 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rpl3P27659 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rpl3P27659 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rpl3P27659 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rpl3P27659 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rpl3P27659 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rpl3P27659 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rpl3P27659 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rpl3P27659 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rpl3P27659 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rpl3P27659 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Rpl3P27659 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rpl3P27659 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rpl3P27659 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rpl3P27659 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rpl3P27659 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms