Protein–RNA interactions for Protein: P27546

Map4, Microtubule-associated protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Map4P27546 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Map4P27546 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Map4P27546 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Map4P27546 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Map4P27546 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Map4P27546 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Map4P27546 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Map4P27546 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Map4P27546 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Map4P27546 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Map4P27546 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Map4P27546 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Map4P27546 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Map4P27546 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Map4P27546 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Map4P27546 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Map4P27546 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Map4P27546 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Map4P27546 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Map4P27546 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Map4P27546 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Map4P27546 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Map4P27546 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Map4P27546 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Map4P27546 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
Map4P27546 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Map4P27546 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Map4P27546 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Map4P27546 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Map4P27546 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Map4P27546 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Map4P27546 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Map4P27546 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Map4P27546 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Map4P27546 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Map4P27546 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Map4P27546 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
Map4P27546 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
Map4P27546 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
Map4P27546 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
Map4P27546 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Map4P27546 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
Map4P27546 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
Map4P27546 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Map4P27546 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Map4P27546 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Map4P27546 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Map4P27546 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Map4P27546 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Map4P27546 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Map4P27546 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Map4P27546 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Map4P27546 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Map4P27546 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Map4P27546 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Map4P27546 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Map4P27546 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Map4P27546 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Map4P27546 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Map4P27546 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Map4P27546 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Map4P27546 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Map4P27546 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Map4P27546 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Map4P27546 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Map4P27546 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Map4P27546 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Map4P27546 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Map4P27546 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Map4P27546 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
Map4P27546 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Map4P27546 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Map4P27546 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Map4P27546 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Map4P27546 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Map4P27546 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Map4P27546 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Map4P27546 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Map4P27546 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Map4P27546 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Map4P27546 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
Map4P27546 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
Map4P27546 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Map4P27546 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Map4P27546 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Map4P27546 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Map4P27546 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Map4P27546 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Map4P27546 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Map4P27546 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Map4P27546 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Map4P27546 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Map4P27546 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Map4P27546 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Map4P27546 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
Map4P27546 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Map4P27546 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Map4P27546 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Map4P27546 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Map4P27546 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 177 ms