Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PdgfraP26618 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
PdgfraP26618 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PdgfraP26618 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PdgfraP26618 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
PdgfraP26618 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PdgfraP26618 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PdgfraP26618 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PdgfraP26618 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PdgfraP26618 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PdgfraP26618 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PdgfraP26618 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PdgfraP26618 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PdgfraP26618 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
PdgfraP26618 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PdgfraP26618 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PdgfraP26618 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
PdgfraP26618 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PdgfraP26618 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PdgfraP26618 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PdgfraP26618 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PdgfraP26618 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21■□□□□ 0.95
PdgfraP26618 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
PdgfraP26618 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PdgfraP26618 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PdgfraP26618 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
PdgfraP26618 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PdgfraP26618 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PdgfraP26618 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PdgfraP26618 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PdgfraP26618 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PdgfraP26618 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PdgfraP26618 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PdgfraP26618 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PdgfraP26618 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PdgfraP26618 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PdgfraP26618 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PdgfraP26618 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PdgfraP26618 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PdgfraP26618 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PdgfraP26618 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PdgfraP26618 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PdgfraP26618 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PdgfraP26618 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PdgfraP26618 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PdgfraP26618 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PdgfraP26618 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PdgfraP26618 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PdgfraP26618 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PdgfraP26618 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PdgfraP26618 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PdgfraP26618 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PdgfraP26618 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PdgfraP26618 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PdgfraP26618 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PdgfraP26618 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PdgfraP26618 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PdgfraP26618 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PdgfraP26618 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PdgfraP26618 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PdgfraP26618 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PdgfraP26618 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PdgfraP26618 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
PdgfraP26618 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
PdgfraP26618 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PdgfraP26618 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PdgfraP26618 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PdgfraP26618 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PdgfraP26618 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PdgfraP26618 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PdgfraP26618 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PdgfraP26618 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PdgfraP26618 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PdgfraP26618 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PdgfraP26618 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PdgfraP26618 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PdgfraP26618 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PdgfraP26618 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PdgfraP26618 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PdgfraP26618 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PdgfraP26618 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PdgfraP26618 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PdgfraP26618 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PdgfraP26618 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PdgfraP26618 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PdgfraP26618 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PdgfraP26618 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PdgfraP26618 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PdgfraP26618 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PdgfraP26618 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PdgfraP26618 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PdgfraP26618 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PdgfraP26618 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PdgfraP26618 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PdgfraP26618 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PdgfraP26618 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PdgfraP26618 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PdgfraP26618 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PdgfraP26618 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PdgfraP26618 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms