Protein–RNA interactions for Protein: P26361

Cftr, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CftrP26361 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
CftrP26361 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
CftrP26361 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
CftrP26361 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
CftrP26361 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
CftrP26361 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC35.21■■■■□ 3.23
CftrP26361 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
CftrP26361 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
CftrP26361 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
CftrP26361 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC35.2■■■■□ 3.23
CftrP26361 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
CftrP26361 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
CftrP26361 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
CftrP26361 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
CftrP26361 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC35.19■■■■□ 3.22
CftrP26361 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
CftrP26361 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
CftrP26361 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
CftrP26361 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
CftrP26361 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
CftrP26361 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
CftrP26361 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
CftrP26361 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC35.18■■■■□ 3.22
CftrP26361 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
CftrP26361 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
CftrP26361 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
CftrP26361 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
CftrP26361 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
CftrP26361 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
CftrP26361 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
CftrP26361 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
CftrP26361 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC35.17■■■■□ 3.22
CftrP26361 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
CftrP26361 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
CftrP26361 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
CftrP26361 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
CftrP26361 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
CftrP26361 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
CftrP26361 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
CftrP26361 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC35.15■■■■□ 3.22
CftrP26361 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC35.15■■■■□ 3.22
CftrP26361 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
CftrP26361 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
CftrP26361 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
CftrP26361 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
CftrP26361 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC35.13■■■■□ 3.21
CftrP26361 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
CftrP26361 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
CftrP26361 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
CftrP26361 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
CftrP26361 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
CftrP26361 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
CftrP26361 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC35.1■■■■□ 3.21
CftrP26361 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
CftrP26361 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC35.1■■■■□ 3.21
CftrP26361 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
CftrP26361 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
CftrP26361 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
CftrP26361 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
CftrP26361 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC35.09■■■■□ 3.21
CftrP26361 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.09■■■■□ 3.21
CftrP26361 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
CftrP26361 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
CftrP26361 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
CftrP26361 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
CftrP26361 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC35.07■■■■□ 3.2
CftrP26361 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
CftrP26361 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
CftrP26361 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
CftrP26361 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
CftrP26361 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
CftrP26361 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC35.05■■■■□ 3.2
CftrP26361 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
CftrP26361 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
CftrP26361 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
CftrP26361 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
CftrP26361 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC35.04■■■■□ 3.2
CftrP26361 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
CftrP26361 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
CftrP26361 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
CftrP26361 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC35.04■■■■□ 3.2
CftrP26361 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
CftrP26361 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
CftrP26361 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
CftrP26361 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
CftrP26361 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC35.03■■■■□ 3.2
CftrP26361 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
CftrP26361 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
CftrP26361 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
CftrP26361 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
CftrP26361 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC35.02■■■■□ 3.2
CftrP26361 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
CftrP26361 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.19
CftrP26361 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC35.01■■■■□ 3.19
CftrP26361 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC35.01■■■■□ 3.19
CftrP26361 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
CftrP26361 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
CftrP26361 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC35■■■■□ 3.19
CftrP26361 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
CftrP26361 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms