Protein–RNA interactions for Protein: P23708

Nfya, Nuclear transcription factor Y subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfyaP23708 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NfyaP23708 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NfyaP23708 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
NfyaP23708 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
NfyaP23708 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
NfyaP23708 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
NfyaP23708 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NfyaP23708 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NfyaP23708 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NfyaP23708 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NfyaP23708 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NfyaP23708 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NfyaP23708 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NfyaP23708 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NfyaP23708 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NfyaP23708 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NfyaP23708 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NfyaP23708 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NfyaP23708 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NfyaP23708 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NfyaP23708 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NfyaP23708 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NfyaP23708 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NfyaP23708 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
NfyaP23708 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NfyaP23708 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NfyaP23708 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NfyaP23708 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NfyaP23708 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NfyaP23708 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NfyaP23708 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NfyaP23708 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NfyaP23708 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NfyaP23708 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NfyaP23708 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NfyaP23708 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NfyaP23708 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
NfyaP23708 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
NfyaP23708 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NfyaP23708 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NfyaP23708 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NfyaP23708 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NfyaP23708 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NfyaP23708 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NfyaP23708 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NfyaP23708 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NfyaP23708 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
NfyaP23708 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NfyaP23708 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NfyaP23708 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NfyaP23708 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NfyaP23708 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NfyaP23708 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NfyaP23708 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NfyaP23708 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NfyaP23708 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NfyaP23708 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NfyaP23708 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NfyaP23708 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NfyaP23708 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NfyaP23708 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NfyaP23708 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NfyaP23708 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NfyaP23708 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NfyaP23708 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NfyaP23708 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NfyaP23708 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NfyaP23708 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NfyaP23708 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NfyaP23708 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NfyaP23708 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NfyaP23708 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NfyaP23708 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
NfyaP23708 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NfyaP23708 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NfyaP23708 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NfyaP23708 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NfyaP23708 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NfyaP23708 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NfyaP23708 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NfyaP23708 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NfyaP23708 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NfyaP23708 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NfyaP23708 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NfyaP23708 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
NfyaP23708 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NfyaP23708 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NfyaP23708 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NfyaP23708 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NfyaP23708 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NfyaP23708 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NfyaP23708 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NfyaP23708 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NfyaP23708 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NfyaP23708 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NfyaP23708 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NfyaP23708 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NfyaP23708 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NfyaP23708 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NfyaP23708 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms