Protein–RNA interactions for Protein: P23591

Tsta3, GDP-L-fucose synthase, mousemouse

Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsta3P23591 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tsta3P23591 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tsta3P23591 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tsta3P23591 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tsta3P23591 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tsta3P23591 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tsta3P23591 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tsta3P23591 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tsta3P23591 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Tsta3P23591 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tsta3P23591 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tsta3P23591 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tsta3P23591 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tsta3P23591 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tsta3P23591 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tsta3P23591 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tsta3P23591 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tsta3P23591 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tsta3P23591 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tsta3P23591 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tsta3P23591 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tsta3P23591 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tsta3P23591 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tsta3P23591 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Tsta3P23591 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tsta3P23591 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tsta3P23591 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tsta3P23591 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tsta3P23591 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tsta3P23591 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tsta3P23591 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tsta3P23591 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tsta3P23591 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tsta3P23591 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tsta3P23591 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tsta3P23591 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tsta3P23591 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tsta3P23591 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Tsta3P23591 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tsta3P23591 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tsta3P23591 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tsta3P23591 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tsta3P23591 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tsta3P23591 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tsta3P23591 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Tsta3P23591 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tsta3P23591 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tsta3P23591 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tsta3P23591 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tsta3P23591 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tsta3P23591 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tsta3P23591 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tsta3P23591 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Tsta3P23591 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tsta3P23591 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tsta3P23591 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tsta3P23591 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tsta3P23591 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tsta3P23591 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tsta3P23591 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tsta3P23591 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tsta3P23591 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tsta3P23591 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tsta3P23591 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tsta3P23591 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Tsta3P23591 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Tsta3P23591 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tsta3P23591 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tsta3P23591 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tsta3P23591 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tsta3P23591 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tsta3P23591 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tsta3P23591 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tsta3P23591 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tsta3P23591 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tsta3P23591 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tsta3P23591 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Tsta3P23591 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tsta3P23591 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tsta3P23591 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tsta3P23591 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tsta3P23591 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tsta3P23591 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tsta3P23591 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tsta3P23591 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tsta3P23591 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tsta3P23591 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tsta3P23591 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tsta3P23591 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tsta3P23591 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tsta3P23591 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tsta3P23591 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tsta3P23591 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tsta3P23591 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tsta3P23591 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Tsta3P23591 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tsta3P23591 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Tsta3P23591 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tsta3P23591 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tsta3P23591 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms