Protein–RNA interactions for Protein: P21958

Tap1, Antigen peptide transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tap1P21958 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tap1P21958 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tap1P21958 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tap1P21958 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Tap1P21958 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tap1P21958 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Tap1P21958 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tap1P21958 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tap1P21958 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tap1P21958 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tap1P21958 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tap1P21958 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tap1P21958 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tap1P21958 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tap1P21958 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tap1P21958 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tap1P21958 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tap1P21958 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tap1P21958 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tap1P21958 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tap1P21958 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tap1P21958 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tap1P21958 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tap1P21958 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tap1P21958 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tap1P21958 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tap1P21958 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tap1P21958 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tap1P21958 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tap1P21958 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Tap1P21958 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Tap1P21958 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tap1P21958 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tap1P21958 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tap1P21958 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tap1P21958 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tap1P21958 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tap1P21958 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tap1P21958 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tap1P21958 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tap1P21958 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tap1P21958 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tap1P21958 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tap1P21958 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tap1P21958 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tap1P21958 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tap1P21958 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tap1P21958 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tap1P21958 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tap1P21958 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tap1P21958 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tap1P21958 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tap1P21958 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tap1P21958 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Tap1P21958 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tap1P21958 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tap1P21958 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tap1P21958 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tap1P21958 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tap1P21958 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tap1P21958 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Tap1P21958 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tap1P21958 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tap1P21958 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tap1P21958 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tap1P21958 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tap1P21958 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tap1P21958 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tap1P21958 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tap1P21958 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tap1P21958 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tap1P21958 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tap1P21958 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tap1P21958 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tap1P21958 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tap1P21958 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tap1P21958 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tap1P21958 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Tap1P21958 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tap1P21958 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tap1P21958 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tap1P21958 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tap1P21958 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tap1P21958 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tap1P21958 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tap1P21958 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tap1P21958 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tap1P21958 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tap1P21958 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tap1P21958 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tap1P21958 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tap1P21958 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tap1P21958 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tap1P21958 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tap1P21958 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Tap1P21958 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tap1P21958 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tap1P21958 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tap1P21958 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tap1P21958 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms