Protein–RNA interactions for Protein: P20664

Prim1, DNA primase small subunit, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prim1P20664 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Prim1P20664 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Prim1P20664 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Prim1P20664 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Prim1P20664 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Prim1P20664 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Prim1P20664 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Prim1P20664 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Prim1P20664 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Prim1P20664 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Prim1P20664 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Prim1P20664 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Prim1P20664 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Prim1P20664 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Prim1P20664 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Prim1P20664 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Prim1P20664 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Prim1P20664 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Prim1P20664 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Prim1P20664 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Prim1P20664 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Prim1P20664 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Prim1P20664 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Prim1P20664 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Prim1P20664 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Prim1P20664 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Prim1P20664 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Prim1P20664 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Prim1P20664 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Prim1P20664 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Prim1P20664 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Prim1P20664 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Prim1P20664 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Prim1P20664 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Prim1P20664 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Prim1P20664 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Prim1P20664 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Prim1P20664 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Prim1P20664 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Prim1P20664 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Prim1P20664 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Prim1P20664 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Prim1P20664 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Prim1P20664 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Prim1P20664 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Prim1P20664 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Prim1P20664 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Prim1P20664 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Prim1P20664 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Prim1P20664 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Prim1P20664 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Prim1P20664 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Prim1P20664 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Prim1P20664 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Prim1P20664 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Prim1P20664 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Prim1P20664 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Prim1P20664 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Prim1P20664 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Prim1P20664 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Prim1P20664 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Prim1P20664 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Prim1P20664 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Prim1P20664 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Prim1P20664 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Prim1P20664 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Prim1P20664 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Prim1P20664 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Prim1P20664 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Prim1P20664 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Prim1P20664 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Prim1P20664 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Prim1P20664 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Prim1P20664 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Prim1P20664 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Prim1P20664 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Prim1P20664 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Prim1P20664 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Prim1P20664 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Prim1P20664 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Prim1P20664 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Prim1P20664 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Prim1P20664 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Prim1P20664 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Prim1P20664 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Prim1P20664 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Prim1P20664 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Prim1P20664 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Prim1P20664 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Prim1P20664 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Prim1P20664 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Prim1P20664 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Prim1P20664 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Prim1P20664 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Prim1P20664 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Prim1P20664 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Prim1P20664 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Prim1P20664 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Prim1P20664 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Prim1P20664 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms