Protein–RNA interactions for Protein: P20489

Fcer1a, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcer1aP20489 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fcer1aP20489 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fcer1aP20489 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fcer1aP20489 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Fcer1aP20489 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fcer1aP20489 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fcer1aP20489 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fcer1aP20489 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fcer1aP20489 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fcer1aP20489 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fcer1aP20489 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fcer1aP20489 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fcer1aP20489 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fcer1aP20489 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fcer1aP20489 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fcer1aP20489 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fcer1aP20489 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fcer1aP20489 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fcer1aP20489 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fcer1aP20489 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fcer1aP20489 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fcer1aP20489 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fcer1aP20489 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fcer1aP20489 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fcer1aP20489 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fcer1aP20489 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fcer1aP20489 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fcer1aP20489 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fcer1aP20489 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fcer1aP20489 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fcer1aP20489 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fcer1aP20489 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fcer1aP20489 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fcer1aP20489 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fcer1aP20489 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fcer1aP20489 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fcer1aP20489 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fcer1aP20489 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fcer1aP20489 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fcer1aP20489 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fcer1aP20489 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fcer1aP20489 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fcer1aP20489 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fcer1aP20489 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fcer1aP20489 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fcer1aP20489 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fcer1aP20489 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fcer1aP20489 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fcer1aP20489 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fcer1aP20489 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fcer1aP20489 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fcer1aP20489 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fcer1aP20489 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fcer1aP20489 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fcer1aP20489 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Fcer1aP20489 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Fcer1aP20489 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fcer1aP20489 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fcer1aP20489 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fcer1aP20489 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Fcer1aP20489 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fcer1aP20489 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fcer1aP20489 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fcer1aP20489 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fcer1aP20489 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fcer1aP20489 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fcer1aP20489 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fcer1aP20489 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fcer1aP20489 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fcer1aP20489 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fcer1aP20489 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fcer1aP20489 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fcer1aP20489 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fcer1aP20489 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fcer1aP20489 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fcer1aP20489 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fcer1aP20489 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fcer1aP20489 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fcer1aP20489 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fcer1aP20489 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fcer1aP20489 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fcer1aP20489 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fcer1aP20489 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fcer1aP20489 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fcer1aP20489 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fcer1aP20489 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fcer1aP20489 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fcer1aP20489 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fcer1aP20489 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fcer1aP20489 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fcer1aP20489 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fcer1aP20489 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fcer1aP20489 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fcer1aP20489 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fcer1aP20489 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fcer1aP20489 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fcer1aP20489 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fcer1aP20489 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fcer1aP20489 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fcer1aP20489 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms