Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PrkcaP20444 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PrkcaP20444 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PrkcaP20444 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PrkcaP20444 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PrkcaP20444 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PrkcaP20444 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PrkcaP20444 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PrkcaP20444 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PrkcaP20444 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PrkcaP20444 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PrkcaP20444 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PrkcaP20444 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PrkcaP20444 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PrkcaP20444 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PrkcaP20444 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PrkcaP20444 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PrkcaP20444 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PrkcaP20444 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PrkcaP20444 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PrkcaP20444 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PrkcaP20444 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PrkcaP20444 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PrkcaP20444 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PrkcaP20444 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PrkcaP20444 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PrkcaP20444 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PrkcaP20444 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PrkcaP20444 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PrkcaP20444 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.5
PrkcaP20444 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PrkcaP20444 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PrkcaP20444 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PrkcaP20444 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PrkcaP20444 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PrkcaP20444 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PrkcaP20444 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PrkcaP20444 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PrkcaP20444 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PrkcaP20444 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PrkcaP20444 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PrkcaP20444 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PrkcaP20444 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PrkcaP20444 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PrkcaP20444 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PrkcaP20444 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PrkcaP20444 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PrkcaP20444 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PrkcaP20444 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PrkcaP20444 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PrkcaP20444 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PrkcaP20444 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PrkcaP20444 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PrkcaP20444 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PrkcaP20444 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PrkcaP20444 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PrkcaP20444 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PrkcaP20444 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PrkcaP20444 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PrkcaP20444 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PrkcaP20444 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PrkcaP20444 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PrkcaP20444 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PrkcaP20444 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PrkcaP20444 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PrkcaP20444 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PrkcaP20444 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PrkcaP20444 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PrkcaP20444 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PrkcaP20444 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PrkcaP20444 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PrkcaP20444 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PrkcaP20444 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PrkcaP20444 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PrkcaP20444 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PrkcaP20444 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PrkcaP20444 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PrkcaP20444 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PrkcaP20444 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PrkcaP20444 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PrkcaP20444 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PrkcaP20444 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PrkcaP20444 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PrkcaP20444 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PrkcaP20444 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PrkcaP20444 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PrkcaP20444 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PrkcaP20444 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PrkcaP20444 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PrkcaP20444 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PrkcaP20444 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
PrkcaP20444 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PrkcaP20444 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PrkcaP20444 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PrkcaP20444 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PrkcaP20444 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PrkcaP20444 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PrkcaP20444 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PrkcaP20444 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PrkcaP20444 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms