Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
P20040 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P20040 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
P20040 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
P20040 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P20040 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P20040 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
P20040 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P20040 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
P20040 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
P20040 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P20040 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
P20040 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
P20040 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
P20040 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
P20040 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P20040 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P20040 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P20040 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
P20040 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P20040 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
P20040 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P20040 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P20040 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P20040 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P20040 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
P20040 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
P20040 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
P20040 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
P20040 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P20040 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P20040 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P20040 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P20040 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
P20040 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
P20040 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
P20040 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
P20040 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
P20040 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
P20040 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
P20040 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
P20040 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
P20040 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
P20040 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
P20040 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
P20040 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P20040 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P20040 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P20040 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
P20040 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P20040 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P20040 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P20040 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P20040 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P20040 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P20040 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P20040 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
P20040 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
P20040 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
P20040 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P20040 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P20040 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
P20040 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P20040 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P20040 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P20040 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P20040 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
P20040 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P20040 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P20040 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
P20040 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
P20040 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
P20040 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
P20040 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
P20040 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
P20040 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
P20040 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
P20040 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
P20040 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
P20040 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
P20040 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
P20040 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
P20040 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
P20040 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
P20040 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
P20040 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
P20040 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
P20040 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
P20040 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
P20040 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
P20040 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
P20040 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
P20040 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
P20040 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
P20040 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
P20040 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
P20040 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
P20040 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
P20040 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
P20040 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
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