Protein–RNA interactions for Protein: P20029

Hspa5, 78 kDa glucose-regulated protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hspa5P20029 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Hspa5P20029 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Hspa5P20029 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Hspa5P20029 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Hspa5P20029 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Hspa5P20029 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Hspa5P20029 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Hspa5P20029 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Hspa5P20029 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Hspa5P20029 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Hspa5P20029 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Hspa5P20029 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Hspa5P20029 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Hspa5P20029 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Hspa5P20029 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Hspa5P20029 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Hspa5P20029 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Hspa5P20029 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Hspa5P20029 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Hspa5P20029 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Hspa5P20029 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Hspa5P20029 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Hspa5P20029 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Hspa5P20029 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Hspa5P20029 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Hspa5P20029 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Hspa5P20029 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
Hspa5P20029 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Hspa5P20029 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC29■■■□□ 2.23
Hspa5P20029 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Hspa5P20029 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Hspa5P20029 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Hspa5P20029 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Hspa5P20029 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Hspa5P20029 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Hspa5P20029 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Hspa5P20029 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Hspa5P20029 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Hspa5P20029 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Hspa5P20029 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Hspa5P20029 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Hspa5P20029 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Hspa5P20029 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Hspa5P20029 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Hspa5P20029 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Hspa5P20029 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Hspa5P20029 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Hspa5P20029 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Hspa5P20029 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Hspa5P20029 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Hspa5P20029 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Hspa5P20029 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Hspa5P20029 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Hspa5P20029 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Hspa5P20029 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Hspa5P20029 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Hspa5P20029 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Hspa5P20029 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Hspa5P20029 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Hspa5P20029 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Hspa5P20029 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Hspa5P20029 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Hspa5P20029 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Hspa5P20029 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Hspa5P20029 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Hspa5P20029 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Hspa5P20029 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Hspa5P20029 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Hspa5P20029 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Hspa5P20029 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Hspa5P20029 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Hspa5P20029 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Hspa5P20029 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Hspa5P20029 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Hspa5P20029 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Hspa5P20029 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Hspa5P20029 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Hspa5P20029 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Hspa5P20029 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Hspa5P20029 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Hspa5P20029 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Hspa5P20029 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Hspa5P20029 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Hspa5P20029 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Hspa5P20029 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Hspa5P20029 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Hspa5P20029 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Hspa5P20029 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Hspa5P20029 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Hspa5P20029 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Hspa5P20029 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Hspa5P20029 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Hspa5P20029 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Hspa5P20029 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Hspa5P20029 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Hspa5P20029 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Hspa5P20029 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Hspa5P20029 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Hspa5P20029 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Hspa5P20029 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms