Protein–RNA interactions for Protein: P19182

Ifrd1, Interferon-related developmental regulator 1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifrd1P19182 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ifrd1P19182 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ifrd1P19182 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ifrd1P19182 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ifrd1P19182 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Ifrd1P19182 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ifrd1P19182 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ifrd1P19182 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ifrd1P19182 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ifrd1P19182 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ifrd1P19182 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ifrd1P19182 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ifrd1P19182 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ifrd1P19182 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ifrd1P19182 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ifrd1P19182 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ifrd1P19182 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ifrd1P19182 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ifrd1P19182 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ifrd1P19182 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ifrd1P19182 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ifrd1P19182 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ifrd1P19182 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ifrd1P19182 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ifrd1P19182 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ifrd1P19182 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ifrd1P19182 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ifrd1P19182 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ifrd1P19182 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ifrd1P19182 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ifrd1P19182 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ifrd1P19182 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ifrd1P19182 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ifrd1P19182 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ifrd1P19182 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ifrd1P19182 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ifrd1P19182 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ifrd1P19182 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ifrd1P19182 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ifrd1P19182 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ifrd1P19182 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ifrd1P19182 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ifrd1P19182 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ifrd1P19182 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ifrd1P19182 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ifrd1P19182 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ifrd1P19182 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ifrd1P19182 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ifrd1P19182 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ifrd1P19182 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ifrd1P19182 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Ifrd1P19182 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ifrd1P19182 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ifrd1P19182 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ifrd1P19182 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ifrd1P19182 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ifrd1P19182 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ifrd1P19182 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ifrd1P19182 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ifrd1P19182 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ifrd1P19182 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ifrd1P19182 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ifrd1P19182 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ifrd1P19182 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ifrd1P19182 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ifrd1P19182 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ifrd1P19182 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ifrd1P19182 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ifrd1P19182 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ifrd1P19182 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ifrd1P19182 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ifrd1P19182 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ifrd1P19182 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ifrd1P19182 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ifrd1P19182 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ifrd1P19182 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Ifrd1P19182 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ifrd1P19182 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ifrd1P19182 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ifrd1P19182 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ifrd1P19182 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ifrd1P19182 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ifrd1P19182 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ifrd1P19182 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ifrd1P19182 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ifrd1P19182 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ifrd1P19182 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ifrd1P19182 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ifrd1P19182 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ifrd1P19182 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ifrd1P19182 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ifrd1P19182 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ifrd1P19182 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ifrd1P19182 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Ifrd1P19182 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Ifrd1P19182 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ifrd1P19182 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ifrd1P19182 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ifrd1P19182 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ifrd1P19182 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.3 ms