Protein–RNA interactions for Protein: P18340

Cxcl9, C-X-C motif chemokine 9, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl9P18340 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cxcl9P18340 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cxcl9P18340 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cxcl9P18340 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Cxcl9P18340 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cxcl9P18340 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cxcl9P18340 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cxcl9P18340 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cxcl9P18340 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cxcl9P18340 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cxcl9P18340 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cxcl9P18340 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cxcl9P18340 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Cxcl9P18340 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cxcl9P18340 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cxcl9P18340 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cxcl9P18340 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cxcl9P18340 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cxcl9P18340 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cxcl9P18340 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cxcl9P18340 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cxcl9P18340 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cxcl9P18340 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cxcl9P18340 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Cxcl9P18340 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cxcl9P18340 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Cxcl9P18340 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cxcl9P18340 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cxcl9P18340 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cxcl9P18340 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Cxcl9P18340 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cxcl9P18340 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cxcl9P18340 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cxcl9P18340 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cxcl9P18340 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cxcl9P18340 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cxcl9P18340 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cxcl9P18340 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cxcl9P18340 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cxcl9P18340 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cxcl9P18340 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cxcl9P18340 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Cxcl9P18340 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cxcl9P18340 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cxcl9P18340 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cxcl9P18340 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cxcl9P18340 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cxcl9P18340 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cxcl9P18340 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cxcl9P18340 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cxcl9P18340 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cxcl9P18340 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cxcl9P18340 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cxcl9P18340 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cxcl9P18340 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cxcl9P18340 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cxcl9P18340 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cxcl9P18340 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cxcl9P18340 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cxcl9P18340 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Cxcl9P18340 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cxcl9P18340 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cxcl9P18340 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cxcl9P18340 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cxcl9P18340 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cxcl9P18340 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cxcl9P18340 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cxcl9P18340 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cxcl9P18340 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cxcl9P18340 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cxcl9P18340 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cxcl9P18340 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cxcl9P18340 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cxcl9P18340 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cxcl9P18340 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cxcl9P18340 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cxcl9P18340 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cxcl9P18340 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cxcl9P18340 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cxcl9P18340 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cxcl9P18340 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cxcl9P18340 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cxcl9P18340 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cxcl9P18340 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cxcl9P18340 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cxcl9P18340 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cxcl9P18340 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cxcl9P18340 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cxcl9P18340 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cxcl9P18340 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cxcl9P18340 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cxcl9P18340 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cxcl9P18340 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cxcl9P18340 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cxcl9P18340 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cxcl9P18340 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cxcl9P18340 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cxcl9P18340 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cxcl9P18340 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cxcl9P18340 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms