Protein–RNA interactions for Protein: P18181

Cd48, CD48 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd48P18181 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd48P18181 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd48P18181 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd48P18181 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd48P18181 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd48P18181 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd48P18181 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd48P18181 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd48P18181 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd48P18181 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd48P18181 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd48P18181 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd48P18181 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd48P18181 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd48P18181 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd48P18181 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd48P18181 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd48P18181 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd48P18181 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd48P18181 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd48P18181 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd48P18181 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd48P18181 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd48P18181 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd48P18181 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd48P18181 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd48P18181 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd48P18181 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd48P18181 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd48P18181 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd48P18181 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd48P18181 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd48P18181 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd48P18181 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd48P18181 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd48P18181 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd48P18181 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd48P18181 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd48P18181 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd48P18181 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd48P18181 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd48P18181 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd48P18181 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd48P18181 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd48P18181 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd48P18181 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cd48P18181 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Cd48P18181 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cd48P18181 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cd48P18181 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cd48P18181 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cd48P18181 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cd48P18181 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cd48P18181 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cd48P18181 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cd48P18181 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cd48P18181 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cd48P18181 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cd48P18181 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cd48P18181 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cd48P18181 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cd48P18181 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cd48P18181 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd48P18181 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd48P18181 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd48P18181 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd48P18181 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd48P18181 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd48P18181 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd48P18181 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd48P18181 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cd48P18181 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cd48P18181 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Cd48P18181 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cd48P18181 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cd48P18181 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Cd48P18181 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cd48P18181 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cd48P18181 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cd48P18181 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cd48P18181 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd48P18181 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd48P18181 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd48P18181 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd48P18181 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd48P18181 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd48P18181 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd48P18181 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd48P18181 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd48P18181 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd48P18181 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd48P18181 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd48P18181 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd48P18181 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd48P18181 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cd48P18181 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cd48P18181 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cd48P18181 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cd48P18181 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cd48P18181 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms