Protein–RNA interactions for Protein: P17918

Pcna, Proliferating cell nuclear antigen, mousemouse

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcnaP17918 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PcnaP17918 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PcnaP17918 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PcnaP17918 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PcnaP17918 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PcnaP17918 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PcnaP17918 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PcnaP17918 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PcnaP17918 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PcnaP17918 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PcnaP17918 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PcnaP17918 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PcnaP17918 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PcnaP17918 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PcnaP17918 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PcnaP17918 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PcnaP17918 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PcnaP17918 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PcnaP17918 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PcnaP17918 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PcnaP17918 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20■□□□□ 0.79
PcnaP17918 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PcnaP17918 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PcnaP17918 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PcnaP17918 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PcnaP17918 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PcnaP17918 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PcnaP17918 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PcnaP17918 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PcnaP17918 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PcnaP17918 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PcnaP17918 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PcnaP17918 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PcnaP17918 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PcnaP17918 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PcnaP17918 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PcnaP17918 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PcnaP17918 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PcnaP17918 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PcnaP17918 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PcnaP17918 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PcnaP17918 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PcnaP17918 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PcnaP17918 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PcnaP17918 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PcnaP17918 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PcnaP17918 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PcnaP17918 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PcnaP17918 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PcnaP17918 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PcnaP17918 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PcnaP17918 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PcnaP17918 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PcnaP17918 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PcnaP17918 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PcnaP17918 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PcnaP17918 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PcnaP17918 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PcnaP17918 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PcnaP17918 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PcnaP17918 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PcnaP17918 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PcnaP17918 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PcnaP17918 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PcnaP17918 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PcnaP17918 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
PcnaP17918 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PcnaP17918 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PcnaP17918 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
PcnaP17918 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PcnaP17918 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PcnaP17918 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PcnaP17918 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PcnaP17918 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PcnaP17918 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PcnaP17918 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PcnaP17918 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PcnaP17918 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PcnaP17918 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PcnaP17918 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PcnaP17918 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PcnaP17918 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PcnaP17918 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PcnaP17918 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PcnaP17918 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PcnaP17918 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PcnaP17918 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PcnaP17918 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PcnaP17918 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PcnaP17918 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PcnaP17918 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PcnaP17918 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PcnaP17918 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PcnaP17918 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PcnaP17918 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PcnaP17918 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PcnaP17918 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PcnaP17918 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PcnaP17918 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PcnaP17918 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms